Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TTF2Q9UNY4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TTF2Q9UNY4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TTF2Q9UNY4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TTF2Q9UNY4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TTF2Q9UNY4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TTF2Q9UNY4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TTF2Q9UNY4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TTF2Q9UNY4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TTF2Q9UNY4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TTF2Q9UNY4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TTF2Q9UNY4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TTF2Q9UNY4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TTF2Q9UNY4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TTF2Q9UNY4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TTF2Q9UNY4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TTF2Q9UNY4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TTF2Q9UNY4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TTF2Q9UNY4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TTF2Q9UNY4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TTF2Q9UNY4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TTF2Q9UNY4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TTF2Q9UNY4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TTF2Q9UNY4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TTF2Q9UNY4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TTF2Q9UNY4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TTF2Q9UNY4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TTF2Q9UNY4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TTF2Q9UNY4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
TTF2Q9UNY4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TTF2Q9UNY4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TTF2Q9UNY4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TTF2Q9UNY4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TTF2Q9UNY4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TTF2Q9UNY4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TTF2Q9UNY4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TTF2Q9UNY4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TTF2Q9UNY4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TTF2Q9UNY4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TTF2Q9UNY4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TTF2Q9UNY4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TTF2Q9UNY4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TTF2Q9UNY4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TTF2Q9UNY4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TTF2Q9UNY4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TTF2Q9UNY4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TTF2Q9UNY4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TTF2Q9UNY4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TTF2Q9UNY4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TTF2Q9UNY4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TTF2Q9UNY4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TTF2Q9UNY4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
TTF2Q9UNY4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TTF2Q9UNY4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TTF2Q9UNY4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TTF2Q9UNY4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TTF2Q9UNY4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TTF2Q9UNY4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
TTF2Q9UNY4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TTF2Q9UNY4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TTF2Q9UNY4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TTF2Q9UNY4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TTF2Q9UNY4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
TTF2Q9UNY4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TTF2Q9UNY4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TTF2Q9UNY4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TTF2Q9UNY4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TTF2Q9UNY4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TTF2Q9UNY4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TTF2Q9UNY4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TTF2Q9UNY4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TTF2Q9UNY4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TTF2Q9UNY4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TTF2Q9UNY4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TTF2Q9UNY4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TTF2Q9UNY4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TTF2Q9UNY4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TTF2Q9UNY4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TTF2Q9UNY4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TTF2Q9UNY4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TTF2Q9UNY4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TTF2Q9UNY4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TTF2Q9UNY4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TTF2Q9UNY4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TTF2Q9UNY4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TTF2Q9UNY4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TTF2Q9UNY4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TTF2Q9UNY4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TTF2Q9UNY4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TTF2Q9UNY4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TTF2Q9UNY4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TTF2Q9UNY4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TTF2Q9UNY4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TTF2Q9UNY4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TTF2Q9UNY4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TTF2Q9UNY4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TTF2Q9UNY4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
TTF2Q9UNY4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TTF2Q9UNY4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TTF2Q9UNY4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms