Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
BARX2Q9UMQ3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
BARX2Q9UMQ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
BARX2Q9UMQ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
BARX2Q9UMQ3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
BARX2Q9UMQ3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
BARX2Q9UMQ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
BARX2Q9UMQ3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
BARX2Q9UMQ3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
BARX2Q9UMQ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
BARX2Q9UMQ3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
BARX2Q9UMQ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
BARX2Q9UMQ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
BARX2Q9UMQ3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
BARX2Q9UMQ3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BARX2Q9UMQ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
BARX2Q9UMQ3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
BARX2Q9UMQ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
BARX2Q9UMQ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
BARX2Q9UMQ3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BARX2Q9UMQ3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BARX2Q9UMQ3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
BARX2Q9UMQ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
BARX2Q9UMQ3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BARX2Q9UMQ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BARX2Q9UMQ3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
BARX2Q9UMQ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
BARX2Q9UMQ3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
BARX2Q9UMQ3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
BARX2Q9UMQ3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
BARX2Q9UMQ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
BARX2Q9UMQ3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BARX2Q9UMQ3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BARX2Q9UMQ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
BARX2Q9UMQ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
BARX2Q9UMQ3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
BARX2Q9UMQ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
BARX2Q9UMQ3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
BARX2Q9UMQ3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
BARX2Q9UMQ3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BARX2Q9UMQ3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BARX2Q9UMQ3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BARX2Q9UMQ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
BARX2Q9UMQ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
BARX2Q9UMQ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BARX2Q9UMQ3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
BARX2Q9UMQ3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
BARX2Q9UMQ3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BARX2Q9UMQ3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
BARX2Q9UMQ3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BARX2Q9UMQ3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BARX2Q9UMQ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BARX2Q9UMQ3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BARX2Q9UMQ3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BARX2Q9UMQ3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BARX2Q9UMQ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
BARX2Q9UMQ3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BARX2Q9UMQ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BARX2Q9UMQ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BARX2Q9UMQ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
BARX2Q9UMQ3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BARX2Q9UMQ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BARX2Q9UMQ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
BARX2Q9UMQ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BARX2Q9UMQ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
BARX2Q9UMQ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BARX2Q9UMQ3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BARX2Q9UMQ3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
BARX2Q9UMQ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BARX2Q9UMQ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
BARX2Q9UMQ3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BARX2Q9UMQ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
BARX2Q9UMQ3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BARX2Q9UMQ3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BARX2Q9UMQ3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BARX2Q9UMQ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
BARX2Q9UMQ3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BARX2Q9UMQ3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BARX2Q9UMQ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BARX2Q9UMQ3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BARX2Q9UMQ3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BARX2Q9UMQ3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BARX2Q9UMQ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BARX2Q9UMQ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BARX2Q9UMQ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BARX2Q9UMQ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
BARX2Q9UMQ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BARX2Q9UMQ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
BARX2Q9UMQ3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BARX2Q9UMQ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BARX2Q9UMQ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BARX2Q9UMQ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BARX2Q9UMQ3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BARX2Q9UMQ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BARX2Q9UMQ3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BARX2Q9UMQ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BARX2Q9UMQ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BARX2Q9UMQ3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BARX2Q9UMQ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BARX2Q9UMQ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms