Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC55.29■■■■■ 6.44
CC2D2AQ9P2K1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.28■■■■■ 6.44
CC2D2AQ9P2K1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC55.28■■■■■ 6.44
CC2D2AQ9P2K1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.25■■■■■ 6.44
CC2D2AQ9P2K1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC55.12■■■■■ 6.41
CC2D2AQ9P2K1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC55.1■■■■■ 6.41
CC2D2AQ9P2K1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC55.07■■■■■ 6.41
CC2D2AQ9P2K1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.02■■■■■ 6.4
CC2D2AQ9P2K1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.97■■■■■ 6.39
CC2D2AQ9P2K1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC54.94■■■■■ 6.39
CC2D2AQ9P2K1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.93■■■■■ 6.38
CC2D2AQ9P2K1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC54.81■■■■■ 6.37
CC2D2AQ9P2K1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.79■■■■■ 6.36
CC2D2AQ9P2K1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC54.73■■■■■ 6.35
CC2D2AQ9P2K1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC54.71■■■■■ 6.35
CC2D2AQ9P2K1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC54.67■■■■■ 6.34
CC2D2AQ9P2K1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC54.59■■■■■ 6.33
CC2D2AQ9P2K1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.57■■■■■ 6.33
CC2D2AQ9P2K1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.55■■■■■ 6.32
CC2D2AQ9P2K1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC54.55■■■■■ 6.32
CC2D2AQ9P2K1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.53■■■■■ 6.32
CC2D2AQ9P2K1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.46■■■■■ 6.31
CC2D2AQ9P2K1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.45■■■■■ 6.31
CC2D2AQ9P2K1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC54.41■■■■■ 6.3
CC2D2AQ9P2K1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC54.4■■■■■ 6.3
CC2D2AQ9P2K1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.35■■■■■ 6.29
CC2D2AQ9P2K1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC54.3■■■■■ 6.28
CC2D2AQ9P2K1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.3■■■■■ 6.28
CC2D2AQ9P2K1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.28■■■■■ 6.28
CC2D2AQ9P2K1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.24■■■■■ 6.27
CC2D2AQ9P2K1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC54.23■■■■■ 6.27
CC2D2AQ9P2K1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC54.2■■■■■ 6.27
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.15■■■■■ 6.26
CC2D2AQ9P2K1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC54.15■■■■■ 6.26
CC2D2AQ9P2K1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC54.14■■■■■ 6.26
CC2D2AQ9P2K1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.13■■■■■ 6.26
CC2D2AQ9P2K1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC54.05■■■■■ 6.24
CC2D2AQ9P2K1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC54.03■■■■■ 6.24
CC2D2AQ9P2K1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC53.98■■■■■ 6.23
CC2D2AQ9P2K1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC53.97■■■■■ 6.23
CC2D2AQ9P2K1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC53.95■■■■■ 6.23
CC2D2AQ9P2K1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC53.95■■■■■ 6.23
CC2D2AQ9P2K1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.91■■■■■ 6.22
CC2D2AQ9P2K1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC53.91■■■■■ 6.22
CC2D2AQ9P2K1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC53.9■■■■■ 6.22
CC2D2AQ9P2K1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
CC2D2AQ9P2K1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.86■■■■■ 6.21
CC2D2AQ9P2K1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.86■■■■■ 6.21
CC2D2AQ9P2K1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.84■■■■■ 6.21
CC2D2AQ9P2K1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC53.81■■■■■ 6.2
CC2D2AQ9P2K1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.79■■■■■ 6.2
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.78■■■■■ 6.2
CC2D2AQ9P2K1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC53.75■■■■■ 6.19
CC2D2AQ9P2K1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC53.68■■■■■ 6.18
CC2D2AQ9P2K1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC53.66■■■■■ 6.18
CC2D2AQ9P2K1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.65■■■■■ 6.18
CC2D2AQ9P2K1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC53.61■■■■■ 6.17
CC2D2AQ9P2K1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC53.61■■■■■ 6.17
CC2D2AQ9P2K1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC53.6■■■■■ 6.17
CC2D2AQ9P2K1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.53■■■■■ 6.16
CC2D2AQ9P2K1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.53■■■■■ 6.16
CC2D2AQ9P2K1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC53.51■■■■■ 6.16
CC2D2AQ9P2K1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC53.43■■■■■ 6.14
CC2D2AQ9P2K1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC53.42■■■■■ 6.14
CC2D2AQ9P2K1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC53.39■■■■■ 6.14
CC2D2AQ9P2K1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.36■■■■■ 6.13
CC2D2AQ9P2K1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC53.35■■■■■ 6.13
CC2D2AQ9P2K1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC53.35■■■■■ 6.13
CC2D2AQ9P2K1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.34■■■■■ 6.13
CC2D2AQ9P2K1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC53.3■■■■■ 6.12
CC2D2AQ9P2K1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.29■■■■■ 6.12
CC2D2AQ9P2K1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC53.28■■■■■ 6.12
CC2D2AQ9P2K1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.27■■■■■ 6.12
CC2D2AQ9P2K1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC53.26■■■■■ 6.12
CC2D2AQ9P2K1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC53.26■■■■■ 6.12
CC2D2AQ9P2K1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC53.26■■■■■ 6.12
CC2D2AQ9P2K1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC53.25■■■■■ 6.12
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC53.23■■■■■ 6.11
CC2D2AQ9P2K1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC53.22■■■■■ 6.11
CC2D2AQ9P2K1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC53.21■■■■■ 6.11
CC2D2AQ9P2K1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.21■■■■■ 6.11
CC2D2AQ9P2K1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.21■■■■■ 6.11
CC2D2AQ9P2K1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.2■■■■■ 6.11
CC2D2AQ9P2K1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC53.15■■■■■ 6.1
CC2D2AQ9P2K1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
CC2D2AQ9P2K1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC53.12■■■■■ 6.09
CC2D2AQ9P2K1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC53.12■■■■■ 6.09
CC2D2AQ9P2K1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC53.11■■■■■ 6.09
CC2D2AQ9P2K1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.09■■■■■ 6.09
CC2D2AQ9P2K1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.07■■■■■ 6.09
CC2D2AQ9P2K1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.06■■■■■ 6.09
CC2D2AQ9P2K1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC52.96■■■■■ 6.07
CC2D2AQ9P2K1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC52.96■■■■■ 6.07
CC2D2AQ9P2K1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.89■■■■■ 6.06
CC2D2AQ9P2K1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC52.85■■■■■ 6.05
CC2D2AQ9P2K1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC52.83■■■■■ 6.05
CC2D2AQ9P2K1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.82■■■■■ 6.05
CC2D2AQ9P2K1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC52.77■■■■■ 6.04
CC2D2AQ9P2K1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC52.77■■■■■ 6.04
CC2D2AQ9P2K1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.76■■■■■ 6.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms