Protein–RNA interactions for Protein: Q9P212

PLCE1, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCE1Q9P212 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLCE1Q9P212 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLCE1Q9P212 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLCE1Q9P212 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLCE1Q9P212 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLCE1Q9P212 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLCE1Q9P212 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLCE1Q9P212 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLCE1Q9P212 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLCE1Q9P212 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLCE1Q9P212 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLCE1Q9P212 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLCE1Q9P212 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLCE1Q9P212 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLCE1Q9P212 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLCE1Q9P212 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLCE1Q9P212 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLCE1Q9P212 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLCE1Q9P212 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLCE1Q9P212 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLCE1Q9P212 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLCE1Q9P212 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLCE1Q9P212 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLCE1Q9P212 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLCE1Q9P212 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLCE1Q9P212 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PLCE1Q9P212 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLCE1Q9P212 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLCE1Q9P212 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLCE1Q9P212 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLCE1Q9P212 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLCE1Q9P212 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLCE1Q9P212 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLCE1Q9P212 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLCE1Q9P212 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLCE1Q9P212 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLCE1Q9P212 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLCE1Q9P212 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLCE1Q9P212 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLCE1Q9P212 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLCE1Q9P212 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLCE1Q9P212 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLCE1Q9P212 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLCE1Q9P212 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLCE1Q9P212 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLCE1Q9P212 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PLCE1Q9P212 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLCE1Q9P212 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLCE1Q9P212 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLCE1Q9P212 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLCE1Q9P212 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLCE1Q9P212 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLCE1Q9P212 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLCE1Q9P212 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLCE1Q9P212 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLCE1Q9P212 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLCE1Q9P212 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLCE1Q9P212 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLCE1Q9P212 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCE1Q9P212 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLCE1Q9P212 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLCE1Q9P212 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLCE1Q9P212 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLCE1Q9P212 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLCE1Q9P212 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLCE1Q9P212 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLCE1Q9P212 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLCE1Q9P212 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLCE1Q9P212 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLCE1Q9P212 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLCE1Q9P212 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCE1Q9P212 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLCE1Q9P212 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLCE1Q9P212 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLCE1Q9P212 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCE1Q9P212 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCE1Q9P212 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCE1Q9P212 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCE1Q9P212 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCE1Q9P212 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCE1Q9P212 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCE1Q9P212 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCE1Q9P212 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCE1Q9P212 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLCE1Q9P212 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCE1Q9P212 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCE1Q9P212 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCE1Q9P212 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCE1Q9P212 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLCE1Q9P212 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLCE1Q9P212 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLCE1Q9P212 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLCE1Q9P212 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLCE1Q9P212 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLCE1Q9P212 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLCE1Q9P212 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PLCE1Q9P212 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLCE1Q9P212 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLCE1Q9P212 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLCE1Q9P212 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms