Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHCHD3Q9NX63 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHCHD3Q9NX63 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHCHD3Q9NX63 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHCHD3Q9NX63 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHCHD3Q9NX63 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHCHD3Q9NX63 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHCHD3Q9NX63 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHCHD3Q9NX63 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHCHD3Q9NX63 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHCHD3Q9NX63 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHCHD3Q9NX63 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHCHD3Q9NX63 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHCHD3Q9NX63 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHCHD3Q9NX63 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHCHD3Q9NX63 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHCHD3Q9NX63 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHCHD3Q9NX63 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHCHD3Q9NX63 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHCHD3Q9NX63 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHCHD3Q9NX63 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHCHD3Q9NX63 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHCHD3Q9NX63 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHCHD3Q9NX63 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHCHD3Q9NX63 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHCHD3Q9NX63 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHCHD3Q9NX63 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHCHD3Q9NX63 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHCHD3Q9NX63 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHCHD3Q9NX63 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHCHD3Q9NX63 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHCHD3Q9NX63 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHCHD3Q9NX63 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHCHD3Q9NX63 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHCHD3Q9NX63 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHCHD3Q9NX63 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHCHD3Q9NX63 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHCHD3Q9NX63 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHCHD3Q9NX63 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHCHD3Q9NX63 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHCHD3Q9NX63 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHCHD3Q9NX63 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHCHD3Q9NX63 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHCHD3Q9NX63 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHCHD3Q9NX63 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD3Q9NX63 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHCHD3Q9NX63 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHCHD3Q9NX63 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHCHD3Q9NX63 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHCHD3Q9NX63 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHCHD3Q9NX63 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHCHD3Q9NX63 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHCHD3Q9NX63 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHCHD3Q9NX63 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHCHD3Q9NX63 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHCHD3Q9NX63 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHCHD3Q9NX63 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHCHD3Q9NX63 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHCHD3Q9NX63 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHCHD3Q9NX63 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHCHD3Q9NX63 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHCHD3Q9NX63 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHCHD3Q9NX63 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHCHD3Q9NX63 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHCHD3Q9NX63 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHCHD3Q9NX63 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHCHD3Q9NX63 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHCHD3Q9NX63 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHCHD3Q9NX63 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHCHD3Q9NX63 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHCHD3Q9NX63 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHCHD3Q9NX63 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHCHD3Q9NX63 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHCHD3Q9NX63 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHCHD3Q9NX63 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHCHD3Q9NX63 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHCHD3Q9NX63 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHCHD3Q9NX63 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHCHD3Q9NX63 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHCHD3Q9NX63 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHCHD3Q9NX63 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHCHD3Q9NX63 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHCHD3Q9NX63 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHCHD3Q9NX63 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHCHD3Q9NX63 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHCHD3Q9NX63 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHCHD3Q9NX63 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHCHD3Q9NX63 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHCHD3Q9NX63 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHCHD3Q9NX63 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHCHD3Q9NX63 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHCHD3Q9NX63 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHCHD3Q9NX63 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHCHD3Q9NX63 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHCHD3Q9NX63 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHCHD3Q9NX63 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHCHD3Q9NX63 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHCHD3Q9NX63 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms