Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.235e-16■■■■■ 74.6
RBM22Q9NW64 CCDC102B-211ENST00000584775 1179 ntTSL 1 (best)11.2□□□□□ -0.621e-32■■■■■ 74.5
RBM22Q9NW64 CCDC102B-202ENST00000577772 1537 ntTSL 27.39□□□□□ -1.231e-32■■■■■ 74.5
RBM22Q9NW64 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.311e-32■■■■■ 74.5
RBM22Q9NW64 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.741e-32■■■■■ 74.5
RBM22Q9NW64 CCDC102B-203ENST00000577800 589 ntTSL 32□□□□□ -2.091e-32■■■■■ 74.5
RBM22Q9NW64 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.181e-32■■■■■ 74.5
RBM22Q9NW64 CCDC102B-206ENST00000581103 324 ntTSL 50.65□□□□□ -2.311e-32■■■■■ 74.5
RBM22Q9NW64 TRIP12-215ENST00000479037 2938 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.277e-19■■■■■ 74.3
RBM22Q9NW64 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.294e-8■■■■■ 73.4
RBM22Q9NW64 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.414e-8■■■■■ 73.4
RBM22Q9NW64 UFD1-205ENST00000459854 5038 ntTSL 1 (best)9.7□□□□□ -0.864e-8■■■■■ 73.4
RBM22Q9NW64 NUP214-227ENST00000531929 593 ntTSL 40.98□□□□□ -2.252e-7■■■■■ 73.2
RBM22Q9NW64 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.561e-13■■■■■ 72.8
RBM22Q9NW64 UBN1-207ENST00000589191 705 ntTSL 317.85■□□□□ 0.451e-13■■■■■ 72.8
RBM22Q9NW64 UBN1-204ENST00000586152 593 ntTSL 215.44■□□□□ 0.061e-13■■■■■ 72.8
RBM22Q9NW64 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-13■■■■■ 72.8
RBM22Q9NW64 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.191e-13■■■■■ 72.8
RBM22Q9NW64 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.573e-12■■■■■ 70
RBM22Q9NW64 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.063e-12■■■■■ 70
RBM22Q9NW64 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.233e-12■■■■■ 70
RBM22Q9NW64 SRP9-202ENST00000366838 540 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.553e-12■■■■■ 70
RBM22Q9NW64 SRP9-205ENST00000626563 329 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.893e-12■■■■■ 70
RBM22Q9NW64 EIF4B-210ENST00000550704 1476 ntTSL 514.31□□□□□ -0.127e-15■■■■■ 69.9
RBM22Q9NW64 EIF4B-205ENST00000549481 1097 ntTSL 513.3□□□□□ -0.287e-15■■■■■ 69.9
RBM22Q9NW64 EIF4B-203ENST00000420463 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.447e-15■■■■■ 69.9
RBM22Q9NW64 EIF4B-202ENST00000416762 1985 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.567e-15■■■■■ 69.9
RBM22Q9NW64 EIF4B-209ENST00000550390 871 ntTSL 58.7□□□□□ -1.027e-15■■■■■ 69.9
RBM22Q9NW64 EIF4B-213ENST00000552490 841 ntTSL 28.67□□□□□ -1.027e-15■■■■■ 69.9
RBM22Q9NW64 EIF4B-207ENST00000549645 590 ntTSL 48.32□□□□□ -1.087e-15■■■■■ 69.9
RBM22Q9NW64 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.137e-15■■■■■ 69.9
RBM22Q9NW64 EIF4B-212ENST00000551527 769 ntTSL 47.81□□□□□ -1.167e-15■■■■■ 69.9
RBM22Q9NW64 EIF4B-204ENST00000549077 885 ntTSL 57.27□□□□□ -1.257e-15■■■■■ 69.9
RBM22Q9NW64 EIF4B-211ENST00000551002 537 ntTSL 44.16□□□□□ -1.747e-15■■■■■ 69.9
RBM22Q9NW64 FANCA-221ENST00000566889 2201 ntTSL 1 (best)24.65■■□□□ 1.543e-17■■■■■ 69.7
RBM22Q9NW64 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.333e-17■■■■■ 69.7
RBM22Q9NW64 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.013e-17■■■■■ 69.7
RBM22Q9NW64 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.33e-17■■■■■ 69.7
RBM22Q9NW64 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.453e-17■■■■■ 69.7
RBM22Q9NW64 FANCA-218ENST00000565582 812 ntTSL 311.89□□□□□ -0.513e-17■■■■■ 69.7
RBM22Q9NW64 NAPB-206ENST00000487502 699 ntTSL 223.72■■□□□ 1.394e-13■■■■■ 69.6
RBM22Q9NW64 NAPB-204ENST00000468128 782 ntTSL 522.03■■□□□ 1.124e-13■■■■■ 69.6
RBM22Q9NW64 PIK3C2A-203ENST00000531428 1593 ntTSL 1 (best)16.09■□□□□ 0.174e-13■■■■■ 69.6
RBM22Q9NW64 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.214e-13■■■■■ 69.6
RBM22Q9NW64 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.334e-13■■■■■ 69.6
RBM22Q9NW64 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.374e-13■■■■■ 69.6
RBM22Q9NW64 NAPB-203ENST00000432543 3754 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.444e-13■■■■■ 69.6
RBM22Q9NW64 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.384e-13■■■■■ 69.6
RBM22Q9NW64 NAPB-205ENST00000472855 1651 ntTSL 26.32□□□□□ -1.44e-13■■■■■ 69.6
RBM22Q9NW64 AP003716.1-203ENST00000533670 613 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.699e-14■■■■■ 67
RBM22Q9NW64 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.469e-14■■■■■ 67
RBM22Q9NW64 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)22.1■■□□□ 1.135e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 219.38■□□□□ 0.695e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 218.51■□□□□ 0.555e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.525e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.155e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 RPL11-204ENST00000467075 377 ntTSL 313.29□□□□□ -0.282e-12■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.335e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.765e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 RAE1-204ENST00000411894 588 ntTSL 59.73□□□□□ -0.852e-12■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 RAE1-205ENST00000429339 480 ntTSL 59.73□□□□□ -0.852e-12■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SPTLC3-204ENST00000450297 645 ntTSL 39.55□□□□□ -0.882e-12■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 59.19□□□□□ -0.945e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 39.19□□□□□ -0.945e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.052e-12■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.08□□□□□ -1.125e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 42.57□□□□□ -25e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 50.98□□□□□ -2.255e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 50.64□□□□□ -2.315e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.375e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 FECH-203ENST00000585494 1874 ntTSL 221.35■■□□□ 1.011e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 FECH-205ENST00000585747 564 ntTSL 420.39■□□□□ 0.851e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 FECH-210ENST00000592699 1049 ntTSL 317.32■□□□□ 0.361e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 FECH-204ENST00000585699 512 ntTSL 415.95■□□□□ 0.141e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.051e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.041e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 UBE3C-207ENST00000494532 543 ntTSL 214.36□□□□□ -0.111e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 FECH-206ENST00000585878 622 ntTSL 414.13□□□□□ -0.151e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 FECH-209ENST00000592111 556 ntTSL 212.08□□□□□ -0.481e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 FECH-207ENST00000591215 590 ntTSL 510.41□□□□□ -0.741e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 UBE3C-205ENST00000470408 5197 ntTSL 29.78□□□□□ -0.841e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 UBE3C-208ENST00000497368 776 ntTSL 25.43□□□□□ -1.541e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.821e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 CCNL1-207ENST00000465947 793 ntTSL 518.06■□□□□ 0.485e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.245e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 CCNL1-222ENST00000479596 883 ntTSL 315.04■□□□□ -05e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 CCNL1-213ENST00000471044 753 ntTSL 212.47□□□□□ -0.415e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 CCNL1-209ENST00000467081 564 ntTSL 32.75□□□□□ -1.975e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 CCNL1-205ENST00000464575 505 ntTSL 42.2□□□□□ -2.065e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 CCNL1-220ENST00000478454 580 ntTSL 41.71□□□□□ -2.145e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 SIRT7-214ENST00000574153 468 ntTSL 213.23□□□□□ -0.295e-9■■■■■ 64.9
RBM22Q9NW64 APBB2-219ENST00000510670 591 ntTSL 517.6■□□□□ 0.416e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-226ENST00000513516 537 ntTSL 517.6■□□□□ 0.416e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.236e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.26e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-223ENST00000512510 539 ntTSL 515.5■□□□□ 0.076e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.146e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-214ENST00000508593 3592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.496e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-213ENST00000507831 575 ntTSL 411.92□□□□□ -0.56e-14■■■■■ 64.5
Retrieved 100 of 21,863 protein–RNA pairs in 144.9 ms