Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVV4

MTPAP, Poly(A) RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTPAPQ9NVV4 PAXIP1-207ENST00000475066 2477 ntTSL 28.34□□□□□ -1.074e-9■■■■■ 32.1
MTPAPQ9NVV4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.971e-6■■■■■ 31.3
MTPAPQ9NVV4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 31.3
MTPAPQ9NVV4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 31.3
MTPAPQ9NVV4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.025e-10■■■■■ 31.2
MTPAPQ9NVV4 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.435e-10■■■■■ 31.2
MTPAPQ9NVV4 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.465e-10■■■■■ 31.2
MTPAPQ9NVV4 ANAPC2-207ENST00000495611 747 ntTSL 219.64■□□□□ 0.738e-9■■■■■ 31.1
MTPAPQ9NVV4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.398e-9■■■■■ 31.1
MTPAPQ9NVV4 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.16□□□□□ -1.744e-8■■■■■ 30.7
MTPAPQ9NVV4 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.261e-8■■■■■ 30.1
MTPAPQ9NVV4 STX16-210ENST00000458280 553 ntTSL 423.14■■□□□ 1.298e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-209ENST00000438253 855 ntTSL 223.14■■□□□ 1.298e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 APBA2-210ENST00000559814 2555 ntTSL 1 (best)18.96■□□□□ 0.638e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-208ENST00000412911 560 ntTSL 417.62■□□□□ 0.418e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-217ENST00000490700 661 ntTSL 317■□□□□ 0.318e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.288e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-201ENST00000312283 785 ntTSL 316.42■□□□□ 0.228e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-215ENST00000476384 936 ntTSL 515.99■□□□□ 0.158e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.128e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 APBA2-201ENST00000382938 1954 ntTSL 215.57■□□□□ 0.088e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-216ENST00000483434 874 ntTSL 315□□□□□ -0.018e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-211ENST00000460655 572 ntTSL 413.97□□□□□ -0.178e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-213ENST00000467096 942 ntTSL 1 (best)13.92□□□□□ -0.188e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.198e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.258e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.268e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-219ENST00000496003 815 ntTSL 513.28□□□□□ -0.288e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.428e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-220ENST00000496117 528 ntTSL 512.11□□□□□ -0.478e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.58e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.58e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.598e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 SUPT5H-216ENST00000599335 3796 ntTSL 211.25□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-214ENST00000468590 691 ntTSL 510.42□□□□□ -0.748e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-218ENST00000493301 597 ntTSL 310.42□□□□□ -0.748e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-206ENST00000371132 4552 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.758e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-204ENST00000359617 4273 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.768e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-203ENST00000358029 4329 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.788e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 STX16-212ENST00000464640 812 ntTSL 26.8□□□□□ -1.328e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 RSF1-211ENST00000532556 495 ntTSL 35.85□□□□□ -1.478e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 TTC37-212ENST00000513823 577 ntTSL 44.17□□□□□ -1.748e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 RSF1-205ENST00000526324 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)3.81□□□□□ -1.88e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 RSF1-210ENST00000531768 626 ntTSL 23.72□□□□□ -1.818e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 TTC37-213ENST00000514952 2102 ntTSL 1 (best)3.44□□□□□ -1.868e-8■■■■■ 29.4
MTPAPQ9NVV4 SMC1A-203ENST00000428014 868 ntTSL 39.62□□□□□ -0.873e-14■■■■■ 28.7
MTPAPQ9NVV4 CCDC57-213ENST00000581625 491 ntTSL 516.75■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 28.1
MTPAPQ9NVV4 CCDC57-212ENST00000578910 796 ntTSL 515.35■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 28.1
MTPAPQ9NVV4 ATP2A3-215ENST00000576957 1159 ntTSL 213.88□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 28.1
MTPAPQ9NVV4 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 28.1
MTPAPQ9NVV4 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 28.1
MTPAPQ9NVV4 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 28.1
MTPAPQ9NVV4 DNMT1-209ENST00000586799 672 ntTSL 512.25□□□□□ -0.455e-9■■■■■ 27.5
MTPAPQ9NVV4 SEPT5-202ENST00000395109 794 ntTSL 213.68□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 27.1
MTPAPQ9NVV4 SEPT5-206ENST00000413258 318 ntTSL 56.54□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 27.1
MTPAPQ9NVV4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.824e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 SUGP1-211ENST00000590439 764 ntTSL 519.57■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 SUGP1-202ENST00000535070 1094 ntTSL 217.85■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 RBM34-204ENST00000468751 648 ntTSL 217.28■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 SUGP1-204ENST00000585763 826 ntTSL 516.66■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 SUGP1-215ENST00000606725 728 ntTSL 316.56■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 SUGP1-208ENST00000588580 715 ntTSL 216.56■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 SUGP1-207ENST00000587716 559 ntTSL 416.53■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 SUGP1-209ENST00000588731 2282 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 SUGP1-206ENST00000587119 2177 ntTSL 215.66■□□□□ 0.14e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 GTF3C1-211ENST00000569653 897 ntTSL 214.6□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 RBM34-208ENST00000485019 409 ntTSL 313.38□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 RBM34-209ENST00000486751 783 ntTSL 213.38□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 RBM34-202ENST00000429912 667 ntTSL 313.38□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 GTF3C1-204ENST00000564664 933 ntTSL 512.84□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 SUGP1-203ENST00000585444 532 ntTSL 412.59□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 GTF3C1-209ENST00000568569 540 ntTSL 512.42□□□□□ -0.424e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 RBM34-205ENST00000474086 882 ntTSL 212.21□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 RBM34-207ENST00000476261 881 ntTSL 1 (best)11.08□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 SUGP1-213ENST00000591350 601 ntTSL 410.57□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 GTF3C1-212ENST00000570129 505 ntTSL 510.33□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 RBM34-203ENST00000447801 1273 ntTSL 510.11□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 NKAP-203ENST00000477789 2345 ntTSL 27.24□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 NKAP-204ENST00000482407 763 ntTSL 37.01□□□□□ -1.294e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.451e-6■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 JAK2-203ENST00000487310 773 ntTSL 24.58□□□□□ -1.684e-7■■■■■ 26.8
MTPAPQ9NVV4 DNHD1-220ENST00000534210 2867 ntTSL 1 (best)14.58□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 26.5
MTPAPQ9NVV4 DNHD1-216ENST00000532027 4881 ntTSL 211.15□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 26.5
MTPAPQ9NVV4 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.392e-6■■■■□ 26.5
MTPAPQ9NVV4 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.422e-6■■■■□ 26.5
MTPAPQ9NVV4 HGS-216ENST00000576498 1004 ntTSL 218.93■□□□□ 0.622e-7■■■■□ 26.1
MTPAPQ9NVV4 HGS-208ENST00000572392 824 ntTSL 516.55■□□□□ 0.242e-7■■■■□ 26.1
MTPAPQ9NVV4 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.23□□□□□ -2.051e-323■■■■□ 25.7
MTPAPQ9NVV4 SEPT5-214ENST00000480423 563 ntTSL 418.47■□□□□ 0.556e-7■■■■□ 25.6
MTPAPQ9NVV4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.689e-7■■■■□ 25.5
MTPAPQ9NVV4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.259e-7■■■■□ 25.5
MTPAPQ9NVV4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.189e-7■■■■□ 25.5
MTPAPQ9NVV4 PTP4A3-205ENST00000523147 558 ntTSL 522.07■■□□□ 1.129e-7■■■■□ 25.5
MTPAPQ9NVV4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.19e-7■■■■□ 25.5
MTPAPQ9NVV4 UBE2I-215ENST00000567074 884 ntTSL 1 (best)20.04■□□□□ 0.89e-7■■■■□ 25.5
MTPAPQ9NVV4 PIEZO1-212ENST00000497793 1228 ntTSL 219.59■□□□□ 0.739e-7■■■■□ 25.5
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