RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.33■□□□□ 0.53
GTF3C1-201ENST00000356183 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
GTF3C1-201ENST00000356183 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1-201ENST00000356183 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
GTF3C1-201ENST00000356183 ERICH6Q7L0X2 663 aa17.52■□□□□ 0.4
GTF3C1-201ENST00000356183 NISCHQ9Y2I1 1504 aa17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1-201ENST00000356183 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
GTF3C1-201ENST00000356183 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1-201ENST00000356183 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
GTF3C1-201ENST00000356183 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
GTF3C1-201ENST00000356183 MYT1Q01538 1121 aa17.07■□□□□ 0.32
GTF3C1-201ENST00000356183 APLP2Q06481 763 aa17.03■□□□□ 0.32
GTF3C1-201ENST00000356183 PCGF6Q9BYE7 350 aa17■□□□□ 0.31
GTF3C1-201ENST00000356183 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
GTF3C1-201ENST00000356183 NEFLP07196 543 aa16.76■□□□□ 0.27
GTF3C1-201ENST00000356183 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
GTF3C1-201ENST00000356183 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
GTF3C1-201ENST00000356183 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
GTF3C1-201ENST00000356183 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
GTF3C1-201ENST00000356183 HRCP23327 699 aa16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1-201ENST00000356183 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
GTF3C1-201ENST00000356183 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
GTF3C1-201ENST00000356183 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.17■□□□□ 0.18
GTF3C1-201ENST00000356183 TRIM41Q8WV44 630 aa16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1-201ENST00000356183 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
GTF3C1-201ENST00000356183 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1-201ENST00000356183 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
GTF3C1-201ENST00000356183 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.96■□□□□ 0.15
GTF3C1-201ENST00000356183 ITGAEP38570 1179 aa15.94■□□□□ 0.14
GTF3C1-201ENST00000356183 BCANQ96GW7 911 aa15.86■□□□□ 0.13
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1-201ENST00000356183 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1-201ENST00000356183 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
GTF3C1-201ENST00000356183 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
GTF3C1-201ENST00000356183 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.74■□□□□ 0.11
GTF3C1-201ENST00000356183 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.73■□□□□ 0.11
GTF3C1-201ENST00000356183 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
GTF3C1-201ENST00000356183 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
GTF3C1-201ENST00000356183 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1-201ENST00000356183 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1-201ENST00000356183 BCL11AQ9H165 835 aa15.58■□□□□ 0.09
GTF3C1-201ENST00000356183 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
GTF3C1-201ENST00000356183 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1-201ENST00000356183 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1-201ENST00000356183 NEUROD1Q13562 356 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF3C1-201ENST00000356183 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
GTF3C1-201ENST00000356183 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1-201ENST00000356183 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1-201ENST00000356183 ANP32CO43423 234 aa15.39■□□□□ 0.05
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC24A1O60721 1099 aa15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
GTF3C1-201ENST00000356183 TRIM52Q96A61 297 aa15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1-201ENST00000356183 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
GTF3C1-201ENST00000356183 NBR1Q14596 966 aa15.28■□□□□ 0.04
GTF3C1-201ENST00000356183 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
GTF3C1-201ENST00000356183 ARXQ96QS3 562 aa15.25■□□□□ 0.03
GTF3C1-201ENST00000356183 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
GTF3C1-201ENST00000356183 FKBP8Q14318 412 aa15.18■□□□□ 0.02
GTF3C1-201ENST00000356183 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa15.06■□□□□ 0
GTF3C1-201ENST00000356183 NEFMP07197 916 aa15.05■□□□□ -0
GTF3C1-201ENST00000356183 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
GTF3C1-201ENST00000356183 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1-201ENST00000356183 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.91□□□□□ -0.02
GTF3C1-201ENST00000356183 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.89□□□□□ -0.03
GTF3C1-201ENST00000356183 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.88□□□□□ -0.03
GTF3C1-201ENST00000356183 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GTF3C1-201ENST00000356183 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
GTF3C1-201ENST00000356183 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
GTF3C1-201ENST00000356183 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
GTF3C1-201ENST00000356183 ABCC9O60706 1549 aa14.84□□□□□ -0.03
GTF3C1-201ENST00000356183 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
GTF3C1-201ENST00000356183 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
GTF3C1-201ENST00000356183 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1-201ENST00000356183 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1-201ENST00000356183 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
GTF3C1-201ENST00000356183 ARID3CA6NKF2 412 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C1-201ENST00000356183 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C1-201ENST00000356183 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
GTF3C1-201ENST00000356183 MIER1Q8N108 512 aa14.74□□□□□ -0.05
GTF3C1-201ENST00000356183 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GTF3C1-201ENST00000356183 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GTF3C1-201ENST00000356183 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GTF3C1-201ENST00000356183 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C1-201ENST00000356183 P3H3Q8IVL6 736 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GTF3C1-201ENST00000356183 BECN1Q14457 450 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C1-201ENST00000356183 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C1-201ENST00000356183 TMC1Q8TDI8 760 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C1-201ENST00000356183 TONSLQ96HA7 1378 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C1-201ENST00000356183 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
GTF3C1-201ENST00000356183 FBLN2P98095 1184 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C1-201ENST00000356183 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C1-201ENST00000356183 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GTF3C1-201ENST00000356183 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GTF3C1-201ENST00000356183 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GTF3C1-201ENST00000356183 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms