Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASF1BQ9NVP2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASF1BQ9NVP2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASF1BQ9NVP2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASF1BQ9NVP2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASF1BQ9NVP2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASF1BQ9NVP2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASF1BQ9NVP2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ASF1BQ9NVP2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ASF1BQ9NVP2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ASF1BQ9NVP2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ASF1BQ9NVP2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ASF1BQ9NVP2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ASF1BQ9NVP2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ASF1BQ9NVP2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASF1BQ9NVP2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASF1BQ9NVP2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASF1BQ9NVP2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASF1BQ9NVP2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASF1BQ9NVP2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASF1BQ9NVP2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ASF1BQ9NVP2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASF1BQ9NVP2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASF1BQ9NVP2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ASF1BQ9NVP2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASF1BQ9NVP2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASF1BQ9NVP2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASF1BQ9NVP2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ASF1BQ9NVP2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASF1BQ9NVP2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASF1BQ9NVP2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASF1BQ9NVP2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASF1BQ9NVP2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ASF1BQ9NVP2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASF1BQ9NVP2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASF1BQ9NVP2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASF1BQ9NVP2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ASF1BQ9NVP2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ASF1BQ9NVP2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASF1BQ9NVP2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASF1BQ9NVP2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASF1BQ9NVP2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASF1BQ9NVP2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASF1BQ9NVP2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ASF1BQ9NVP2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASF1BQ9NVP2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ASF1BQ9NVP2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASF1BQ9NVP2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASF1BQ9NVP2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ASF1BQ9NVP2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASF1BQ9NVP2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASF1BQ9NVP2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASF1BQ9NVP2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ASF1BQ9NVP2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASF1BQ9NVP2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASF1BQ9NVP2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASF1BQ9NVP2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASF1BQ9NVP2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASF1BQ9NVP2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ASF1BQ9NVP2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASF1BQ9NVP2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASF1BQ9NVP2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASF1BQ9NVP2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ASF1BQ9NVP2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ASF1BQ9NVP2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ASF1BQ9NVP2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ASF1BQ9NVP2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ASF1BQ9NVP2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ASF1BQ9NVP2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASF1BQ9NVP2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ASF1BQ9NVP2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ASF1BQ9NVP2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ASF1BQ9NVP2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASF1BQ9NVP2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ASF1BQ9NVP2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ASF1BQ9NVP2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ASF1BQ9NVP2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASF1BQ9NVP2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASF1BQ9NVP2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASF1BQ9NVP2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASF1BQ9NVP2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASF1BQ9NVP2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASF1BQ9NVP2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASF1BQ9NVP2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASF1BQ9NVP2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASF1BQ9NVP2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ASF1BQ9NVP2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASF1BQ9NVP2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ASF1BQ9NVP2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASF1BQ9NVP2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASF1BQ9NVP2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASF1BQ9NVP2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASF1BQ9NVP2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ASF1BQ9NVP2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASF1BQ9NVP2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASF1BQ9NVP2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ASF1BQ9NVP2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASF1BQ9NVP2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASF1BQ9NVP2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASF1BQ9NVP2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms