Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS00

C1GALT1, Glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1GALT1Q9NS00 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C1GALT1Q9NS00 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C1GALT1Q9NS00 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C1GALT1Q9NS00 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C1GALT1Q9NS00 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C1GALT1Q9NS00 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C1GALT1Q9NS00 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C1GALT1Q9NS00 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C1GALT1Q9NS00 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C1GALT1Q9NS00 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C1GALT1Q9NS00 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C1GALT1Q9NS00 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C1GALT1Q9NS00 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C1GALT1Q9NS00 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
C1GALT1Q9NS00 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C1GALT1Q9NS00 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C1GALT1Q9NS00 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C1GALT1Q9NS00 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C1GALT1Q9NS00 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C1GALT1Q9NS00 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
C1GALT1Q9NS00 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C1GALT1Q9NS00 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C1GALT1Q9NS00 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C1GALT1Q9NS00 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
C1GALT1Q9NS00 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C1GALT1Q9NS00 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C1GALT1Q9NS00 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
C1GALT1Q9NS00 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
C1GALT1Q9NS00 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C1GALT1Q9NS00 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C1GALT1Q9NS00 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C1GALT1Q9NS00 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C1GALT1Q9NS00 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C1GALT1Q9NS00 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C1GALT1Q9NS00 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C1GALT1Q9NS00 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C1GALT1Q9NS00 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C1GALT1Q9NS00 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C1GALT1Q9NS00 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C1GALT1Q9NS00 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C1GALT1Q9NS00 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C1GALT1Q9NS00 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C1GALT1Q9NS00 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C1GALT1Q9NS00 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C1GALT1Q9NS00 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C1GALT1Q9NS00 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C1GALT1Q9NS00 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C1GALT1Q9NS00 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C1GALT1Q9NS00 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C1GALT1Q9NS00 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C1GALT1Q9NS00 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1GALT1Q9NS00 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1GALT1Q9NS00 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1GALT1Q9NS00 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1GALT1Q9NS00 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C1GALT1Q9NS00 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C1GALT1Q9NS00 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C1GALT1Q9NS00 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C1GALT1Q9NS00 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C1GALT1Q9NS00 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C1GALT1Q9NS00 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C1GALT1Q9NS00 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C1GALT1Q9NS00 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C1GALT1Q9NS00 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1GALT1Q9NS00 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C1GALT1Q9NS00 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C1GALT1Q9NS00 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C1GALT1Q9NS00 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C1GALT1Q9NS00 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C1GALT1Q9NS00 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C1GALT1Q9NS00 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C1GALT1Q9NS00 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C1GALT1Q9NS00 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1GALT1Q9NS00 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1GALT1Q9NS00 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C1GALT1Q9NS00 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1GALT1Q9NS00 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C1GALT1Q9NS00 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C1GALT1Q9NS00 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
C1GALT1Q9NS00 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C1GALT1Q9NS00 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C1GALT1Q9NS00 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C1GALT1Q9NS00 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
C1GALT1Q9NS00 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C1GALT1Q9NS00 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C1GALT1Q9NS00 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C1GALT1Q9NS00 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C1GALT1Q9NS00 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C1GALT1Q9NS00 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C1GALT1Q9NS00 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1GALT1Q9NS00 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C1GALT1Q9NS00 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C1GALT1Q9NS00 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C1GALT1Q9NS00 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C1GALT1Q9NS00 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C1GALT1Q9NS00 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C1GALT1Q9NS00 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C1GALT1Q9NS00 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C1GALT1Q9NS00 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C1GALT1Q9NS00 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms