Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
STRN4Q9NRL3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
STRN4Q9NRL3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
STRN4Q9NRL3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
STRN4Q9NRL3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
STRN4Q9NRL3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
STRN4Q9NRL3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
STRN4Q9NRL3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
STRN4Q9NRL3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
STRN4Q9NRL3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
STRN4Q9NRL3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
STRN4Q9NRL3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
STRN4Q9NRL3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
STRN4Q9NRL3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
STRN4Q9NRL3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
STRN4Q9NRL3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
STRN4Q9NRL3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
STRN4Q9NRL3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
STRN4Q9NRL3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
STRN4Q9NRL3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
STRN4Q9NRL3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
STRN4Q9NRL3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
STRN4Q9NRL3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
STRN4Q9NRL3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
STRN4Q9NRL3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.27■■■■□ 3.88
STRN4Q9NRL3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
STRN4Q9NRL3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
STRN4Q9NRL3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
STRN4Q9NRL3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
STRN4Q9NRL3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
STRN4Q9NRL3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
STRN4Q9NRL3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
STRN4Q9NRL3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
STRN4Q9NRL3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
STRN4Q9NRL3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
STRN4Q9NRL3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
STRN4Q9NRL3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
STRN4Q9NRL3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
STRN4Q9NRL3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
STRN4Q9NRL3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
STRN4Q9NRL3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
STRN4Q9NRL3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
STRN4Q9NRL3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
STRN4Q9NRL3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
STRN4Q9NRL3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
STRN4Q9NRL3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
STRN4Q9NRL3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
STRN4Q9NRL3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
STRN4Q9NRL3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
STRN4Q9NRL3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
STRN4Q9NRL3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
STRN4Q9NRL3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
STRN4Q9NRL3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
STRN4Q9NRL3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
STRN4Q9NRL3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
STRN4Q9NRL3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
STRN4Q9NRL3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
STRN4Q9NRL3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
STRN4Q9NRL3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
STRN4Q9NRL3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
STRN4Q9NRL3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
STRN4Q9NRL3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
STRN4Q9NRL3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
STRN4Q9NRL3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
STRN4Q9NRL3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
STRN4Q9NRL3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
STRN4Q9NRL3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
STRN4Q9NRL3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
STRN4Q9NRL3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
STRN4Q9NRL3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
STRN4Q9NRL3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
STRN4Q9NRL3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
STRN4Q9NRL3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
STRN4Q9NRL3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
STRN4Q9NRL3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
STRN4Q9NRL3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
STRN4Q9NRL3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
STRN4Q9NRL3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
STRN4Q9NRL3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
STRN4Q9NRL3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
STRN4Q9NRL3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
STRN4Q9NRL3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
STRN4Q9NRL3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
STRN4Q9NRL3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
STRN4Q9NRL3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
STRN4Q9NRL3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
STRN4Q9NRL3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
STRN4Q9NRL3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
STRN4Q9NRL3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
STRN4Q9NRL3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
STRN4Q9NRL3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
STRN4Q9NRL3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
STRN4Q9NRL3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
STRN4Q9NRL3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
STRN4Q9NRL3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.2■■■■□ 3.71
STRN4Q9NRL3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
STRN4Q9NRL3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
STRN4Q9NRL3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
STRN4Q9NRL3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
STRN4Q9NRL3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms