Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIMMDC1Q9NPL8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIMMDC1Q9NPL8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIMMDC1Q9NPL8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIMMDC1Q9NPL8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIMMDC1Q9NPL8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIMMDC1Q9NPL8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIMMDC1Q9NPL8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TIMMDC1Q9NPL8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIMMDC1Q9NPL8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TIMMDC1Q9NPL8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIMMDC1Q9NPL8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TIMMDC1Q9NPL8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TIMMDC1Q9NPL8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMMDC1Q9NPL8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TIMMDC1Q9NPL8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIMMDC1Q9NPL8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIMMDC1Q9NPL8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIMMDC1Q9NPL8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TIMMDC1Q9NPL8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TIMMDC1Q9NPL8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIMMDC1Q9NPL8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TIMMDC1Q9NPL8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIMMDC1Q9NPL8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TIMMDC1Q9NPL8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TIMMDC1Q9NPL8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIMMDC1Q9NPL8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TIMMDC1Q9NPL8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TIMMDC1Q9NPL8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TIMMDC1Q9NPL8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TIMMDC1Q9NPL8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TIMMDC1Q9NPL8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIMMDC1Q9NPL8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TIMMDC1Q9NPL8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TIMMDC1Q9NPL8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TIMMDC1Q9NPL8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TIMMDC1Q9NPL8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TIMMDC1Q9NPL8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TIMMDC1Q9NPL8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TIMMDC1Q9NPL8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TIMMDC1Q9NPL8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TIMMDC1Q9NPL8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TIMMDC1Q9NPL8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TIMMDC1Q9NPL8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TIMMDC1Q9NPL8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TIMMDC1Q9NPL8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TIMMDC1Q9NPL8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TIMMDC1Q9NPL8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TIMMDC1Q9NPL8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TIMMDC1Q9NPL8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TIMMDC1Q9NPL8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TIMMDC1Q9NPL8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TIMMDC1Q9NPL8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TIMMDC1Q9NPL8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TIMMDC1Q9NPL8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TIMMDC1Q9NPL8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TIMMDC1Q9NPL8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TIMMDC1Q9NPL8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TIMMDC1Q9NPL8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TIMMDC1Q9NPL8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TIMMDC1Q9NPL8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TIMMDC1Q9NPL8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TIMMDC1Q9NPL8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TIMMDC1Q9NPL8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TIMMDC1Q9NPL8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TIMMDC1Q9NPL8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TIMMDC1Q9NPL8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TIMMDC1Q9NPL8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TIMMDC1Q9NPL8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TIMMDC1Q9NPL8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TIMMDC1Q9NPL8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIMMDC1Q9NPL8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIMMDC1Q9NPL8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIMMDC1Q9NPL8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TIMMDC1Q9NPL8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TIMMDC1Q9NPL8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIMMDC1Q9NPL8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIMMDC1Q9NPL8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIMMDC1Q9NPL8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIMMDC1Q9NPL8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TIMMDC1Q9NPL8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TIMMDC1Q9NPL8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TIMMDC1Q9NPL8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIMMDC1Q9NPL8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIMMDC1Q9NPL8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms