Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TAF1DQ9H5J8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TAF1DQ9H5J8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TAF1DQ9H5J8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TAF1DQ9H5J8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TAF1DQ9H5J8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TAF1DQ9H5J8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TAF1DQ9H5J8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
TAF1DQ9H5J8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TAF1DQ9H5J8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TAF1DQ9H5J8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TAF1DQ9H5J8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
TAF1DQ9H5J8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
TAF1DQ9H5J8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TAF1DQ9H5J8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
TAF1DQ9H5J8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TAF1DQ9H5J8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TAF1DQ9H5J8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TAF1DQ9H5J8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
TAF1DQ9H5J8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TAF1DQ9H5J8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
TAF1DQ9H5J8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TAF1DQ9H5J8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TAF1DQ9H5J8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TAF1DQ9H5J8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TAF1DQ9H5J8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TAF1DQ9H5J8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TAF1DQ9H5J8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TAF1DQ9H5J8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TAF1DQ9H5J8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TAF1DQ9H5J8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TAF1DQ9H5J8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TAF1DQ9H5J8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TAF1DQ9H5J8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TAF1DQ9H5J8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TAF1DQ9H5J8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TAF1DQ9H5J8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TAF1DQ9H5J8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TAF1DQ9H5J8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TAF1DQ9H5J8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TAF1DQ9H5J8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TAF1DQ9H5J8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TAF1DQ9H5J8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TAF1DQ9H5J8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TAF1DQ9H5J8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TAF1DQ9H5J8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TAF1DQ9H5J8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TAF1DQ9H5J8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TAF1DQ9H5J8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TAF1DQ9H5J8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TAF1DQ9H5J8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TAF1DQ9H5J8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TAF1DQ9H5J8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TAF1DQ9H5J8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TAF1DQ9H5J8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TAF1DQ9H5J8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
TAF1DQ9H5J8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
TAF1DQ9H5J8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TAF1DQ9H5J8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TAF1DQ9H5J8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TAF1DQ9H5J8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TAF1DQ9H5J8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TAF1DQ9H5J8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TAF1DQ9H5J8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
TAF1DQ9H5J8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TAF1DQ9H5J8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TAF1DQ9H5J8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TAF1DQ9H5J8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
TAF1DQ9H5J8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TAF1DQ9H5J8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TAF1DQ9H5J8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TAF1DQ9H5J8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TAF1DQ9H5J8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TAF1DQ9H5J8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TAF1DQ9H5J8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TAF1DQ9H5J8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TAF1DQ9H5J8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TAF1DQ9H5J8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
TAF1DQ9H5J8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TAF1DQ9H5J8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TAF1DQ9H5J8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TAF1DQ9H5J8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TAF1DQ9H5J8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TAF1DQ9H5J8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TAF1DQ9H5J8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TAF1DQ9H5J8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TAF1DQ9H5J8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TAF1DQ9H5J8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
TAF1DQ9H5J8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TAF1DQ9H5J8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TAF1DQ9H5J8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TAF1DQ9H5J8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TAF1DQ9H5J8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TAF1DQ9H5J8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
TAF1DQ9H5J8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TAF1DQ9H5J8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TAF1DQ9H5J8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TAF1DQ9H5J8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TAF1DQ9H5J8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TAF1DQ9H5J8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms