Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ4

TRIM34, Tripartite motif-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM34Q9BYJ4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM34Q9BYJ4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TRIM34Q9BYJ4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRIM34Q9BYJ4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRIM34Q9BYJ4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRIM34Q9BYJ4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM34Q9BYJ4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM34Q9BYJ4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM34Q9BYJ4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM34Q9BYJ4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM34Q9BYJ4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM34Q9BYJ4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM34Q9BYJ4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM34Q9BYJ4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM34Q9BYJ4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM34Q9BYJ4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM34Q9BYJ4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM34Q9BYJ4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM34Q9BYJ4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM34Q9BYJ4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM34Q9BYJ4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRIM34Q9BYJ4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM34Q9BYJ4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM34Q9BYJ4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM34Q9BYJ4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM34Q9BYJ4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM34Q9BYJ4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM34Q9BYJ4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TRIM34Q9BYJ4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM34Q9BYJ4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM34Q9BYJ4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM34Q9BYJ4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM34Q9BYJ4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM34Q9BYJ4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM34Q9BYJ4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM34Q9BYJ4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM34Q9BYJ4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM34Q9BYJ4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM34Q9BYJ4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM34Q9BYJ4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM34Q9BYJ4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM34Q9BYJ4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM34Q9BYJ4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM34Q9BYJ4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TRIM34Q9BYJ4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM34Q9BYJ4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TRIM34Q9BYJ4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM34Q9BYJ4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM34Q9BYJ4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM34Q9BYJ4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM34Q9BYJ4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM34Q9BYJ4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM34Q9BYJ4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM34Q9BYJ4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM34Q9BYJ4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM34Q9BYJ4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM34Q9BYJ4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM34Q9BYJ4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM34Q9BYJ4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM34Q9BYJ4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM34Q9BYJ4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM34Q9BYJ4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM34Q9BYJ4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM34Q9BYJ4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM34Q9BYJ4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM34Q9BYJ4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM34Q9BYJ4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM34Q9BYJ4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM34Q9BYJ4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM34Q9BYJ4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM34Q9BYJ4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM34Q9BYJ4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM34Q9BYJ4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM34Q9BYJ4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM34Q9BYJ4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM34Q9BYJ4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM34Q9BYJ4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM34Q9BYJ4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM34Q9BYJ4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM34Q9BYJ4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM34Q9BYJ4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM34Q9BYJ4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM34Q9BYJ4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM34Q9BYJ4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM34Q9BYJ4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM34Q9BYJ4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM34Q9BYJ4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM34Q9BYJ4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM34Q9BYJ4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM34Q9BYJ4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM34Q9BYJ4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM34Q9BYJ4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM34Q9BYJ4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM34Q9BYJ4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRIM34Q9BYJ4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM34Q9BYJ4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM34Q9BYJ4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM34Q9BYJ4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM34Q9BYJ4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM34Q9BYJ4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms