Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC49.04■■■■■ 5.44
ARAP1Q96P48 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
ARAP1Q96P48 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
ARAP1Q96P48 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
ARAP1Q96P48 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC48.9■■■■■ 5.42
ARAP1Q96P48 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC48.81■■■■■ 5.4
ARAP1Q96P48 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC48.8■■■■■ 5.4
ARAP1Q96P48 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC48.76■■■■■ 5.4
ARAP1Q96P48 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC48.67■■■■■ 5.38
ARAP1Q96P48 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
ARAP1Q96P48 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC48.59■■■■■ 5.37
ARAP1Q96P48 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
ARAP1Q96P48 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.48■■■■■ 5.35
ARAP1Q96P48 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC48.48■■■■■ 5.35
ARAP1Q96P48 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
ARAP1Q96P48 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.34
ARAP1Q96P48 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC48.39■■■■■ 5.34
ARAP1Q96P48 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
ARAP1Q96P48 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
ARAP1Q96P48 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
ARAP1Q96P48 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.29■■■■■ 5.32
ARAP1Q96P48 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC48.29■■■■■ 5.32
ARAP1Q96P48 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC48.28■■■■■ 5.32
ARAP1Q96P48 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC48.27■■■■■ 5.32
ARAP1Q96P48 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
ARAP1Q96P48 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.23■■■■■ 5.31
ARAP1Q96P48 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
ARAP1Q96P48 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.31
ARAP1Q96P48 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
ARAP1Q96P48 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC48.16■■■■■ 5.3
ARAP1Q96P48 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC48.12■■■■■ 5.29
ARAP1Q96P48 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.12■■■■■ 5.29
ARAP1Q96P48 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
ARAP1Q96P48 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC48.04■■■■■ 5.28
ARAP1Q96P48 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC48.03■■■■■ 5.28
ARAP1Q96P48 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC48.01■■■■■ 5.28
ARAP1Q96P48 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48■■■■■ 5.27
ARAP1Q96P48 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC47.93■■■■■ 5.26
ARAP1Q96P48 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
ARAP1Q96P48 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
ARAP1Q96P48 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.86■■■■■ 5.25
ARAP1Q96P48 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC47.86■■■■■ 5.25
ARAP1Q96P48 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
ARAP1Q96P48 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC47.84■■■■■ 5.25
ARAP1Q96P48 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC47.83■■■■■ 5.25
ARAP1Q96P48 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
ARAP1Q96P48 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC47.78■■■■■ 5.24
ARAP1Q96P48 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.78■■■■■ 5.24
ARAP1Q96P48 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
ARAP1Q96P48 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC47.72■■■■■ 5.23
ARAP1Q96P48 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
ARAP1Q96P48 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
ARAP1Q96P48 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.69■■■■■ 5.22
ARAP1Q96P48 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC47.68■■■■■ 5.22
ARAP1Q96P48 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
ARAP1Q96P48 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.68■■■■■ 5.22
ARAP1Q96P48 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC47.65■■■■■ 5.22
ARAP1Q96P48 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
ARAP1Q96P48 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC47.61■■■■■ 5.21
ARAP1Q96P48 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC47.57■■■■■ 5.21
ARAP1Q96P48 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC47.5■■■■■ 5.19
ARAP1Q96P48 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC47.46■■■■■ 5.19
ARAP1Q96P48 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
ARAP1Q96P48 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
ARAP1Q96P48 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC47.39■■■■■ 5.18
ARAP1Q96P48 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.17
ARAP1Q96P48 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC47.38■■■■■ 5.17
ARAP1Q96P48 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC47.38■■■■■ 5.17
ARAP1Q96P48 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC47.37■■■■■ 5.17
ARAP1Q96P48 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC47.36■■■■■ 5.17
ARAP1Q96P48 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.33■■■■■ 5.17
ARAP1Q96P48 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC47.29■■■■■ 5.16
ARAP1Q96P48 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
ARAP1Q96P48 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC47.28■■■■■ 5.16
ARAP1Q96P48 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
ARAP1Q96P48 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
ARAP1Q96P48 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
ARAP1Q96P48 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC47.21■■■■■ 5.15
ARAP1Q96P48 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
ARAP1Q96P48 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.15
ARAP1Q96P48 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
ARAP1Q96P48 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
ARAP1Q96P48 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.15■■■■■ 5.14
ARAP1Q96P48 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.13■■■■■ 5.13
ARAP1Q96P48 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
ARAP1Q96P48 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
ARAP1Q96P48 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC47.07■■■■■ 5.13
ARAP1Q96P48 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
ARAP1Q96P48 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC47.03■■■■■ 5.12
ARAP1Q96P48 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
ARAP1Q96P48 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
ARAP1Q96P48 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
ARAP1Q96P48 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC47.01■■■■■ 5.12
ARAP1Q96P48 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC47.01■■■■■ 5.12
ARAP1Q96P48 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
ARAP1Q96P48 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
ARAP1Q96P48 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC46.96■■■■■ 5.11
ARAP1Q96P48 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
ARAP1Q96P48 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
ARAP1Q96P48 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC46.87■■■■■ 5.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms