Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLMNQ96JQ2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CLMNQ96JQ2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CLMNQ96JQ2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CLMNQ96JQ2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CLMNQ96JQ2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLMNQ96JQ2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLMNQ96JQ2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CLMNQ96JQ2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLMNQ96JQ2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLMNQ96JQ2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLMNQ96JQ2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLMNQ96JQ2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLMNQ96JQ2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLMNQ96JQ2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CLMNQ96JQ2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLMNQ96JQ2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
CLMNQ96JQ2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLMNQ96JQ2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLMNQ96JQ2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLMNQ96JQ2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLMNQ96JQ2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLMNQ96JQ2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLMNQ96JQ2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CLMNQ96JQ2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CLMNQ96JQ2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLMNQ96JQ2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CLMNQ96JQ2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLMNQ96JQ2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLMNQ96JQ2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLMNQ96JQ2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLMNQ96JQ2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLMNQ96JQ2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CLMNQ96JQ2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
CLMNQ96JQ2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLMNQ96JQ2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLMNQ96JQ2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLMNQ96JQ2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CLMNQ96JQ2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLMNQ96JQ2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLMNQ96JQ2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CLMNQ96JQ2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLMNQ96JQ2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLMNQ96JQ2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLMNQ96JQ2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLMNQ96JQ2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLMNQ96JQ2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLMNQ96JQ2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLMNQ96JQ2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLMNQ96JQ2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLMNQ96JQ2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLMNQ96JQ2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLMNQ96JQ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLMNQ96JQ2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLMNQ96JQ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLMNQ96JQ2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLMNQ96JQ2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLMNQ96JQ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLMNQ96JQ2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLMNQ96JQ2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLMNQ96JQ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLMNQ96JQ2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLMNQ96JQ2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLMNQ96JQ2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLMNQ96JQ2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CLMNQ96JQ2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CLMNQ96JQ2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLMNQ96JQ2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLMNQ96JQ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLMNQ96JQ2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLMNQ96JQ2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLMNQ96JQ2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CLMNQ96JQ2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLMNQ96JQ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLMNQ96JQ2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CLMNQ96JQ2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLMNQ96JQ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLMNQ96JQ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLMNQ96JQ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLMNQ96JQ2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLMNQ96JQ2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLMNQ96JQ2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLMNQ96JQ2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLMNQ96JQ2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLMNQ96JQ2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLMNQ96JQ2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLMNQ96JQ2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLMNQ96JQ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CLMNQ96JQ2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLMNQ96JQ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLMNQ96JQ2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLMNQ96JQ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLMNQ96JQ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CLMNQ96JQ2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLMNQ96JQ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLMNQ96JQ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLMNQ96JQ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLMNQ96JQ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CLMNQ96JQ2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLMNQ96JQ2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.8 ms