Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH3KBP1Q96B97 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH3KBP1Q96B97 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH3KBP1Q96B97 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH3KBP1Q96B97 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH3KBP1Q96B97 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH3KBP1Q96B97 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH3KBP1Q96B97 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3KBP1Q96B97 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH3KBP1Q96B97 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH3KBP1Q96B97 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH3KBP1Q96B97 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH3KBP1Q96B97 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SH3KBP1Q96B97 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH3KBP1Q96B97 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH3KBP1Q96B97 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH3KBP1Q96B97 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH3KBP1Q96B97 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH3KBP1Q96B97 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3KBP1Q96B97 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH3KBP1Q96B97 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH3KBP1Q96B97 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH3KBP1Q96B97 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH3KBP1Q96B97 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SH3KBP1Q96B97 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SH3KBP1Q96B97 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SH3KBP1Q96B97 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH3KBP1Q96B97 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SH3KBP1Q96B97 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SH3KBP1Q96B97 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH3KBP1Q96B97 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH3KBP1Q96B97 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH3KBP1Q96B97 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH3KBP1Q96B97 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SH3KBP1Q96B97 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH3KBP1Q96B97 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH3KBP1Q96B97 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH3KBP1Q96B97 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SH3KBP1Q96B97 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH3KBP1Q96B97 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH3KBP1Q96B97 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH3KBP1Q96B97 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3KBP1Q96B97 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3KBP1Q96B97 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3KBP1Q96B97 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3KBP1Q96B97 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3KBP1Q96B97 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH3KBP1Q96B97 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH3KBP1Q96B97 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH3KBP1Q96B97 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH3KBP1Q96B97 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH3KBP1Q96B97 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH3KBP1Q96B97 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH3KBP1Q96B97 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH3KBP1Q96B97 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH3KBP1Q96B97 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3KBP1Q96B97 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH3KBP1Q96B97 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SH3KBP1Q96B97 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH3KBP1Q96B97 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH3KBP1Q96B97 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3KBP1Q96B97 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3KBP1Q96B97 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH3KBP1Q96B97 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3KBP1Q96B97 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3KBP1Q96B97 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3KBP1Q96B97 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3KBP1Q96B97 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3KBP1Q96B97 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3KBP1Q96B97 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3KBP1Q96B97 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3KBP1Q96B97 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3KBP1Q96B97 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SH3KBP1Q96B97 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH3KBP1Q96B97 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH3KBP1Q96B97 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3KBP1Q96B97 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH3KBP1Q96B97 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH3KBP1Q96B97 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH3KBP1Q96B97 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH3KBP1Q96B97 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH3KBP1Q96B97 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH3KBP1Q96B97 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3KBP1Q96B97 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3KBP1Q96B97 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH3KBP1Q96B97 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH3KBP1Q96B97 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH3KBP1Q96B97 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH3KBP1Q96B97 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH3KBP1Q96B97 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH3KBP1Q96B97 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SH3KBP1Q96B97 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH3KBP1Q96B97 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH3KBP1Q96B97 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH3KBP1Q96B97 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH3KBP1Q96B97 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH3KBP1Q96B97 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SH3KBP1Q96B97 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH3KBP1Q96B97 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH3KBP1Q96B97 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms