Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRN2Q92932 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRN2Q92932 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRN2Q92932 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRN2Q92932 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRN2Q92932 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRN2Q92932 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRN2Q92932 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRN2Q92932 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRN2Q92932 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRN2Q92932 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRN2Q92932 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRN2Q92932 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRN2Q92932 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRN2Q92932 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRN2Q92932 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRN2Q92932 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRN2Q92932 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRN2Q92932 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRN2Q92932 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRN2Q92932 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRN2Q92932 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRN2Q92932 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRN2Q92932 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRN2Q92932 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRN2Q92932 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRN2Q92932 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRN2Q92932 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRN2Q92932 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRN2Q92932 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRN2Q92932 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRN2Q92932 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRN2Q92932 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRN2Q92932 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRN2Q92932 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRN2Q92932 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRN2Q92932 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRN2Q92932 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTPRN2Q92932 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRN2Q92932 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRN2Q92932 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRN2Q92932 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRN2Q92932 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRN2Q92932 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRN2Q92932 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRN2Q92932 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRN2Q92932 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRN2Q92932 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRN2Q92932 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRN2Q92932 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRN2Q92932 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRN2Q92932 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRN2Q92932 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRN2Q92932 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRN2Q92932 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRN2Q92932 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRN2Q92932 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRN2Q92932 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRN2Q92932 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRN2Q92932 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRN2Q92932 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRN2Q92932 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRN2Q92932 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRN2Q92932 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRN2Q92932 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRN2Q92932 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRN2Q92932 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRN2Q92932 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRN2Q92932 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRN2Q92932 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRN2Q92932 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRN2Q92932 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRN2Q92932 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRN2Q92932 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRN2Q92932 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRN2Q92932 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRN2Q92932 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRN2Q92932 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRN2Q92932 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRN2Q92932 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRN2Q92932 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRN2Q92932 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRN2Q92932 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRN2Q92932 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRN2Q92932 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRN2Q92932 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRN2Q92932 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRN2Q92932 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRN2Q92932 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRN2Q92932 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRN2Q92932 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRN2Q92932 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRN2Q92932 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRN2Q92932 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRN2Q92932 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRN2Q92932 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRN2Q92932 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRN2Q92932 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRN2Q92932 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRN2Q92932 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.5 ms