Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
TNRQ92752 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
TNRQ92752 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
TNRQ92752 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
TNRQ92752 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
TNRQ92752 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
TNRQ92752 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
TNRQ92752 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
TNRQ92752 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
TNRQ92752 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
TNRQ92752 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
TNRQ92752 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
TNRQ92752 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
TNRQ92752 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
TNRQ92752 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
TNRQ92752 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.51
TNRQ92752 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
TNRQ92752 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
TNRQ92752 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
TNRQ92752 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
TNRQ92752 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
TNRQ92752 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC43.03■■■■■ 4.48
TNRQ92752 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
TNRQ92752 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
TNRQ92752 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
TNRQ92752 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
TNRQ92752 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
TNRQ92752 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
TNRQ92752 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
TNRQ92752 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
TNRQ92752 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
TNRQ92752 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
TNRQ92752 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
TNRQ92752 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
TNRQ92752 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
TNRQ92752 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
TNRQ92752 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
TNRQ92752 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
TNRQ92752 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TNRQ92752 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
TNRQ92752 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
TNRQ92752 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
TNRQ92752 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
TNRQ92752 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
TNRQ92752 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
TNRQ92752 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
TNRQ92752 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
TNRQ92752 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
TNRQ92752 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
TNRQ92752 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
TNRQ92752 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
TNRQ92752 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
TNRQ92752 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
TNRQ92752 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
TNRQ92752 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TNRQ92752 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
TNRQ92752 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TNRQ92752 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
TNRQ92752 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
TNRQ92752 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
TNRQ92752 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
TNRQ92752 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
TNRQ92752 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
TNRQ92752 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
TNRQ92752 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
TNRQ92752 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.17■■■■■ 4.34
TNRQ92752 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
TNRQ92752 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
TNRQ92752 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
TNRQ92752 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
TNRQ92752 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TNRQ92752 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
TNRQ92752 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
TNRQ92752 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
TNRQ92752 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TNRQ92752 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TNRQ92752 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TNRQ92752 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TNRQ92752 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
TNRQ92752 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
TNRQ92752 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
TNRQ92752 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
TNRQ92752 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
TNRQ92752 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
TNRQ92752 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
TNRQ92752 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
TNRQ92752 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
TNRQ92752 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
TNRQ92752 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.8■■■■■ 4.28
TNRQ92752 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
TNRQ92752 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
TNRQ92752 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
TNRQ92752 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
TNRQ92752 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TNRQ92752 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
TNRQ92752 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TNRQ92752 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
TNRQ92752 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
TNRQ92752 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
TNRQ92752 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms