Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
TRIM41Q8WV44 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC50.21■■■■■ 5.63
TRIM41Q8WV44 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC50.16■■■■■ 5.62
TRIM41Q8WV44 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
TRIM41Q8WV44 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.1■■■■■ 5.61
TRIM41Q8WV44 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
TRIM41Q8WV44 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC50.08■■■■■ 5.61
TRIM41Q8WV44 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50.02■■■■■ 5.6
TRIM41Q8WV44 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC50■■■■■ 5.59
TRIM41Q8WV44 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
TRIM41Q8WV44 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
TRIM41Q8WV44 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC49.97■■■■■ 5.59
TRIM41Q8WV44 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
TRIM41Q8WV44 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC49.91■■■■■ 5.58
TRIM41Q8WV44 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
TRIM41Q8WV44 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
TRIM41Q8WV44 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC49.85■■■■■ 5.57
TRIM41Q8WV44 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
TRIM41Q8WV44 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC49.78■■■■■ 5.56
TRIM41Q8WV44 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
TRIM41Q8WV44 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC49.76■■■■■ 5.56
TRIM41Q8WV44 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC49.76■■■■■ 5.56
TRIM41Q8WV44 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC49.74■■■■■ 5.55
TRIM41Q8WV44 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.71■■■■■ 5.55
TRIM41Q8WV44 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC49.71■■■■■ 5.55
TRIM41Q8WV44 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC49.7■■■■■ 5.55
TRIM41Q8WV44 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.69■■■■■ 5.55
TRIM41Q8WV44 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
TRIM41Q8WV44 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC49.68■■■■■ 5.54
TRIM41Q8WV44 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
TRIM41Q8WV44 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.66■■■■■ 5.54
TRIM41Q8WV44 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC49.56■■■■■ 5.52
TRIM41Q8WV44 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.55■■■■■ 5.52
TRIM41Q8WV44 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
TRIM41Q8WV44 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
TRIM41Q8WV44 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC49.5■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC49.45■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.44■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC49.44■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC49.44■■■■■ 5.51
TRIM41Q8WV44 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
TRIM41Q8WV44 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
TRIM41Q8WV44 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
TRIM41Q8WV44 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.3■■■■■ 5.48
TRIM41Q8WV44 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC49.29■■■■■ 5.48
TRIM41Q8WV44 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
TRIM41Q8WV44 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC49.24■■■■■ 5.47
TRIM41Q8WV44 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.19■■■■■ 5.46
TRIM41Q8WV44 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC49.18■■■■■ 5.46
TRIM41Q8WV44 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
TRIM41Q8WV44 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
TRIM41Q8WV44 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
TRIM41Q8WV44 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC49.06■■■■■ 5.44
TRIM41Q8WV44 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC49.05■■■■■ 5.44
TRIM41Q8WV44 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC49.04■■■■■ 5.44
TRIM41Q8WV44 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
TRIM41Q8WV44 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
TRIM41Q8WV44 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC49.01■■■■■ 5.44
TRIM41Q8WV44 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC49■■■■■ 5.43
TRIM41Q8WV44 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC49■■■■■ 5.43
TRIM41Q8WV44 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.98■■■■■ 5.43
TRIM41Q8WV44 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC48.95■■■■■ 5.43
TRIM41Q8WV44 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC48.94■■■■■ 5.43
TRIM41Q8WV44 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
TRIM41Q8WV44 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC48.89■■■■■ 5.42
TRIM41Q8WV44 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
TRIM41Q8WV44 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC48.81■■■■■ 5.4
TRIM41Q8WV44 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC48.8■■■■■ 5.4
TRIM41Q8WV44 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
TRIM41Q8WV44 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
TRIM41Q8WV44 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC48.76■■■■■ 5.4
TRIM41Q8WV44 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.4
TRIM41Q8WV44 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC48.74■■■■■ 5.39
TRIM41Q8WV44 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
TRIM41Q8WV44 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC48.71■■■■■ 5.39
TRIM41Q8WV44 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.68■■■■■ 5.38
TRIM41Q8WV44 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.68■■■■■ 5.38
TRIM41Q8WV44 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC48.66■■■■■ 5.38
TRIM41Q8WV44 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC48.65■■■■■ 5.38
TRIM41Q8WV44 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
TRIM41Q8WV44 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
TRIM41Q8WV44 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
TRIM41Q8WV44 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
TRIM41Q8WV44 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
TRIM41Q8WV44 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
TRIM41Q8WV44 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.57■■■■■ 5.37
TRIM41Q8WV44 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC48.56■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC48.53■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
TRIM41Q8WV44 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC48.48■■■■■ 5.35
TRIM41Q8WV44 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC48.48■■■■■ 5.35
TRIM41Q8WV44 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC48.44■■■■■ 5.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms