Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACBD4Q8NC06 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACBD4Q8NC06 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACBD4Q8NC06 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACBD4Q8NC06 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACBD4Q8NC06 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACBD4Q8NC06 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACBD4Q8NC06 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACBD4Q8NC06 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ACBD4Q8NC06 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACBD4Q8NC06 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACBD4Q8NC06 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACBD4Q8NC06 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACBD4Q8NC06 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACBD4Q8NC06 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACBD4Q8NC06 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACBD4Q8NC06 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACBD4Q8NC06 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACBD4Q8NC06 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACBD4Q8NC06 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACBD4Q8NC06 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACBD4Q8NC06 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACBD4Q8NC06 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACBD4Q8NC06 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACBD4Q8NC06 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACBD4Q8NC06 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACBD4Q8NC06 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACBD4Q8NC06 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACBD4Q8NC06 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACBD4Q8NC06 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACBD4Q8NC06 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACBD4Q8NC06 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACBD4Q8NC06 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACBD4Q8NC06 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACBD4Q8NC06 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACBD4Q8NC06 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACBD4Q8NC06 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACBD4Q8NC06 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACBD4Q8NC06 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACBD4Q8NC06 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACBD4Q8NC06 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACBD4Q8NC06 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACBD4Q8NC06 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACBD4Q8NC06 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ACBD4Q8NC06 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACBD4Q8NC06 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACBD4Q8NC06 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACBD4Q8NC06 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACBD4Q8NC06 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACBD4Q8NC06 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACBD4Q8NC06 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACBD4Q8NC06 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACBD4Q8NC06 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACBD4Q8NC06 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACBD4Q8NC06 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACBD4Q8NC06 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ACBD4Q8NC06 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ACBD4Q8NC06 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACBD4Q8NC06 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACBD4Q8NC06 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACBD4Q8NC06 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACBD4Q8NC06 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACBD4Q8NC06 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACBD4Q8NC06 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACBD4Q8NC06 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ACBD4Q8NC06 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACBD4Q8NC06 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACBD4Q8NC06 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACBD4Q8NC06 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACBD4Q8NC06 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACBD4Q8NC06 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACBD4Q8NC06 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACBD4Q8NC06 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACBD4Q8NC06 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACBD4Q8NC06 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACBD4Q8NC06 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACBD4Q8NC06 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACBD4Q8NC06 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ACBD4Q8NC06 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACBD4Q8NC06 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACBD4Q8NC06 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACBD4Q8NC06 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACBD4Q8NC06 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACBD4Q8NC06 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACBD4Q8NC06 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACBD4Q8NC06 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACBD4Q8NC06 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACBD4Q8NC06 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACBD4Q8NC06 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACBD4Q8NC06 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACBD4Q8NC06 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACBD4Q8NC06 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACBD4Q8NC06 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACBD4Q8NC06 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACBD4Q8NC06 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACBD4Q8NC06 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACBD4Q8NC06 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACBD4Q8NC06 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACBD4Q8NC06 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACBD4Q8NC06 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 403.2 ms