Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PROM2Q8N271 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PROM2Q8N271 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PROM2Q8N271 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PROM2Q8N271 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PROM2Q8N271 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PROM2Q8N271 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PROM2Q8N271 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PROM2Q8N271 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PROM2Q8N271 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
PROM2Q8N271 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PROM2Q8N271 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
PROM2Q8N271 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
PROM2Q8N271 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
PROM2Q8N271 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PROM2Q8N271 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PROM2Q8N271 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
PROM2Q8N271 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
PROM2Q8N271 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PROM2Q8N271 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PROM2Q8N271 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PROM2Q8N271 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PROM2Q8N271 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
PROM2Q8N271 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PROM2Q8N271 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PROM2Q8N271 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PROM2Q8N271 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
PROM2Q8N271 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PROM2Q8N271 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PROM2Q8N271 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PROM2Q8N271 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PROM2Q8N271 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
PROM2Q8N271 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
PROM2Q8N271 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PROM2Q8N271 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PROM2Q8N271 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PROM2Q8N271 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PROM2Q8N271 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PROM2Q8N271 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PROM2Q8N271 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PROM2Q8N271 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PROM2Q8N271 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PROM2Q8N271 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PROM2Q8N271 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PROM2Q8N271 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PROM2Q8N271 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PROM2Q8N271 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PROM2Q8N271 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PROM2Q8N271 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PROM2Q8N271 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PROM2Q8N271 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PROM2Q8N271 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PROM2Q8N271 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PROM2Q8N271 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PROM2Q8N271 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PROM2Q8N271 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PROM2Q8N271 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PROM2Q8N271 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PROM2Q8N271 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
PROM2Q8N271 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PROM2Q8N271 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PROM2Q8N271 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PROM2Q8N271 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PROM2Q8N271 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PROM2Q8N271 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PROM2Q8N271 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PROM2Q8N271 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PROM2Q8N271 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PROM2Q8N271 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PROM2Q8N271 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PROM2Q8N271 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
PROM2Q8N271 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PROM2Q8N271 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PROM2Q8N271 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PROM2Q8N271 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PROM2Q8N271 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PROM2Q8N271 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PROM2Q8N271 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PROM2Q8N271 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PROM2Q8N271 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PROM2Q8N271 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
PROM2Q8N271 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PROM2Q8N271 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
PROM2Q8N271 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PROM2Q8N271 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PROM2Q8N271 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PROM2Q8N271 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PROM2Q8N271 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
PROM2Q8N271 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PROM2Q8N271 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PROM2Q8N271 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PROM2Q8N271 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PROM2Q8N271 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PROM2Q8N271 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PROM2Q8N271 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PROM2Q8N271 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PROM2Q8N271 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
PROM2Q8N271 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PROM2Q8N271 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
PROM2Q8N271 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms