Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZQ1

WDFY3, WD repeat and FYVE domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDFY3Q8IZQ1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WDFY3Q8IZQ1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
WDFY3Q8IZQ1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDFY3Q8IZQ1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDFY3Q8IZQ1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDFY3Q8IZQ1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
WDFY3Q8IZQ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
WDFY3Q8IZQ1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WDFY3Q8IZQ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
WDFY3Q8IZQ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WDFY3Q8IZQ1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
WDFY3Q8IZQ1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WDFY3Q8IZQ1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WDFY3Q8IZQ1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
WDFY3Q8IZQ1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WDFY3Q8IZQ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WDFY3Q8IZQ1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDFY3Q8IZQ1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WDFY3Q8IZQ1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
WDFY3Q8IZQ1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDFY3Q8IZQ1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDFY3Q8IZQ1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDFY3Q8IZQ1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDFY3Q8IZQ1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDFY3Q8IZQ1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDFY3Q8IZQ1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDFY3Q8IZQ1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDFY3Q8IZQ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
WDFY3Q8IZQ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WDFY3Q8IZQ1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WDFY3Q8IZQ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDFY3Q8IZQ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDFY3Q8IZQ1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDFY3Q8IZQ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDFY3Q8IZQ1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDFY3Q8IZQ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDFY3Q8IZQ1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDFY3Q8IZQ1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDFY3Q8IZQ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
WDFY3Q8IZQ1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDFY3Q8IZQ1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDFY3Q8IZQ1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
WDFY3Q8IZQ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WDFY3Q8IZQ1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WDFY3Q8IZQ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
WDFY3Q8IZQ1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDFY3Q8IZQ1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WDFY3Q8IZQ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDFY3Q8IZQ1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDFY3Q8IZQ1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
WDFY3Q8IZQ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDFY3Q8IZQ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDFY3Q8IZQ1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDFY3Q8IZQ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDFY3Q8IZQ1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDFY3Q8IZQ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
WDFY3Q8IZQ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
WDFY3Q8IZQ1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
WDFY3Q8IZQ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
WDFY3Q8IZQ1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WDFY3Q8IZQ1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
WDFY3Q8IZQ1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WDFY3Q8IZQ1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDFY3Q8IZQ1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDFY3Q8IZQ1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDFY3Q8IZQ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDFY3Q8IZQ1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
WDFY3Q8IZQ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
WDFY3Q8IZQ1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WDFY3Q8IZQ1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WDFY3Q8IZQ1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WDFY3Q8IZQ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WDFY3Q8IZQ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
WDFY3Q8IZQ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDFY3Q8IZQ1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDFY3Q8IZQ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
WDFY3Q8IZQ1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
WDFY3Q8IZQ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
WDFY3Q8IZQ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
WDFY3Q8IZQ1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDFY3Q8IZQ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDFY3Q8IZQ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDFY3Q8IZQ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDFY3Q8IZQ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDFY3Q8IZQ1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
WDFY3Q8IZQ1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDFY3Q8IZQ1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
WDFY3Q8IZQ1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
WDFY3Q8IZQ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDFY3Q8IZQ1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDFY3Q8IZQ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDFY3Q8IZQ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
WDFY3Q8IZQ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDFY3Q8IZQ1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDFY3Q8IZQ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
WDFY3Q8IZQ1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDFY3Q8IZQ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDFY3Q8IZQ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDFY3Q8IZQ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDFY3Q8IZQ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
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