Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL0

NAV3, Neuron navigator 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAV3Q8IVL0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NAV3Q8IVL0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NAV3Q8IVL0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NAV3Q8IVL0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NAV3Q8IVL0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NAV3Q8IVL0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NAV3Q8IVL0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NAV3Q8IVL0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAV3Q8IVL0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NAV3Q8IVL0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAV3Q8IVL0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAV3Q8IVL0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAV3Q8IVL0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NAV3Q8IVL0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAV3Q8IVL0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NAV3Q8IVL0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAV3Q8IVL0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAV3Q8IVL0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAV3Q8IVL0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAV3Q8IVL0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAV3Q8IVL0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAV3Q8IVL0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAV3Q8IVL0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAV3Q8IVL0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NAV3Q8IVL0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAV3Q8IVL0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAV3Q8IVL0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NAV3Q8IVL0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAV3Q8IVL0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAV3Q8IVL0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAV3Q8IVL0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAV3Q8IVL0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAV3Q8IVL0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAV3Q8IVL0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAV3Q8IVL0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAV3Q8IVL0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAV3Q8IVL0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NAV3Q8IVL0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAV3Q8IVL0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAV3Q8IVL0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAV3Q8IVL0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAV3Q8IVL0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAV3Q8IVL0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NAV3Q8IVL0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAV3Q8IVL0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NAV3Q8IVL0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAV3Q8IVL0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAV3Q8IVL0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAV3Q8IVL0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAV3Q8IVL0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NAV3Q8IVL0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAV3Q8IVL0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAV3Q8IVL0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAV3Q8IVL0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAV3Q8IVL0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAV3Q8IVL0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAV3Q8IVL0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NAV3Q8IVL0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAV3Q8IVL0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAV3Q8IVL0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAV3Q8IVL0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NAV3Q8IVL0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NAV3Q8IVL0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NAV3Q8IVL0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAV3Q8IVL0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAV3Q8IVL0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NAV3Q8IVL0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NAV3Q8IVL0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAV3Q8IVL0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAV3Q8IVL0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAV3Q8IVL0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAV3Q8IVL0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAV3Q8IVL0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAV3Q8IVL0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAV3Q8IVL0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAV3Q8IVL0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAV3Q8IVL0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAV3Q8IVL0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAV3Q8IVL0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAV3Q8IVL0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAV3Q8IVL0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NAV3Q8IVL0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NAV3Q8IVL0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAV3Q8IVL0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAV3Q8IVL0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAV3Q8IVL0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAV3Q8IVL0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NAV3Q8IVL0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAV3Q8IVL0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAV3Q8IVL0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAV3Q8IVL0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAV3Q8IVL0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAV3Q8IVL0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAV3Q8IVL0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAV3Q8IVL0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NAV3Q8IVL0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NAV3Q8IVL0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NAV3Q8IVL0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAV3Q8IVL0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAV3Q8IVL0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms