Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
UBE2Q1Q7Z7E8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBE2Q1Q7Z7E8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
UBE2Q1Q7Z7E8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
UBE2Q1Q7Z7E8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
UBE2Q1Q7Z7E8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
UBE2Q1Q7Z7E8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
UBE2Q1Q7Z7E8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
UBE2Q1Q7Z7E8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
UBE2Q1Q7Z7E8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
UBE2Q1Q7Z7E8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
UBE2Q1Q7Z7E8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
UBE2Q1Q7Z7E8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
UBE2Q1Q7Z7E8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
UBE2Q1Q7Z7E8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
UBE2Q1Q7Z7E8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
UBE2Q1Q7Z7E8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
UBE2Q1Q7Z7E8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
UBE2Q1Q7Z7E8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
UBE2Q1Q7Z7E8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
UBE2Q1Q7Z7E8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
UBE2Q1Q7Z7E8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
UBE2Q1Q7Z7E8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
UBE2Q1Q7Z7E8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
UBE2Q1Q7Z7E8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
UBE2Q1Q7Z7E8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
UBE2Q1Q7Z7E8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
UBE2Q1Q7Z7E8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
UBE2Q1Q7Z7E8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
UBE2Q1Q7Z7E8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
UBE2Q1Q7Z7E8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
UBE2Q1Q7Z7E8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
UBE2Q1Q7Z7E8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
UBE2Q1Q7Z7E8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
UBE2Q1Q7Z7E8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
UBE2Q1Q7Z7E8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UBE2Q1Q7Z7E8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
UBE2Q1Q7Z7E8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
UBE2Q1Q7Z7E8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
UBE2Q1Q7Z7E8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
UBE2Q1Q7Z7E8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
UBE2Q1Q7Z7E8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
UBE2Q1Q7Z7E8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
UBE2Q1Q7Z7E8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
UBE2Q1Q7Z7E8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
UBE2Q1Q7Z7E8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
UBE2Q1Q7Z7E8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
UBE2Q1Q7Z7E8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
UBE2Q1Q7Z7E8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
UBE2Q1Q7Z7E8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
UBE2Q1Q7Z7E8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
UBE2Q1Q7Z7E8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
UBE2Q1Q7Z7E8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
UBE2Q1Q7Z7E8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
UBE2Q1Q7Z7E8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
UBE2Q1Q7Z7E8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
UBE2Q1Q7Z7E8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
UBE2Q1Q7Z7E8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
UBE2Q1Q7Z7E8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
UBE2Q1Q7Z7E8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
UBE2Q1Q7Z7E8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
UBE2Q1Q7Z7E8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
UBE2Q1Q7Z7E8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
UBE2Q1Q7Z7E8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
UBE2Q1Q7Z7E8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
UBE2Q1Q7Z7E8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
UBE2Q1Q7Z7E8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
UBE2Q1Q7Z7E8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
UBE2Q1Q7Z7E8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
UBE2Q1Q7Z7E8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
UBE2Q1Q7Z7E8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
UBE2Q1Q7Z7E8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
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