Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
PREX2Q70Z35 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
PREX2Q70Z35 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
PREX2Q70Z35 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC45.32■■■■■ 4.85
PREX2Q70Z35 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
PREX2Q70Z35 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
PREX2Q70Z35 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
PREX2Q70Z35 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
PREX2Q70Z35 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC45.23■■■■■ 4.83
PREX2Q70Z35 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
PREX2Q70Z35 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
PREX2Q70Z35 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
PREX2Q70Z35 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
PREX2Q70Z35 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
PREX2Q70Z35 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC45.01■■■■■ 4.8
PREX2Q70Z35 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
PREX2Q70Z35 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
PREX2Q70Z35 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
PREX2Q70Z35 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
PREX2Q70Z35 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
PREX2Q70Z35 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
PREX2Q70Z35 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
PREX2Q70Z35 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
PREX2Q70Z35 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
PREX2Q70Z35 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
PREX2Q70Z35 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
PREX2Q70Z35 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
PREX2Q70Z35 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
PREX2Q70Z35 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
PREX2Q70Z35 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
PREX2Q70Z35 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
PREX2Q70Z35 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
PREX2Q70Z35 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC44.65■■■■■ 4.74
PREX2Q70Z35 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
PREX2Q70Z35 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
PREX2Q70Z35 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
PREX2Q70Z35 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
PREX2Q70Z35 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
PREX2Q70Z35 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
PREX2Q70Z35 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
PREX2Q70Z35 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
PREX2Q70Z35 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
PREX2Q70Z35 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
PREX2Q70Z35 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
PREX2Q70Z35 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
PREX2Q70Z35 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
PREX2Q70Z35 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC44.37■■■■■ 4.69
PREX2Q70Z35 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
PREX2Q70Z35 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC44.33■■■■■ 4.69
PREX2Q70Z35 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
PREX2Q70Z35 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.68
PREX2Q70Z35 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
PREX2Q70Z35 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
PREX2Q70Z35 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
PREX2Q70Z35 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
PREX2Q70Z35 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
PREX2Q70Z35 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
PREX2Q70Z35 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
PREX2Q70Z35 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC44.16■■■■■ 4.66
PREX2Q70Z35 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
PREX2Q70Z35 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC44.12■■■■■ 4.65
PREX2Q70Z35 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC44.11■■■■■ 4.65
PREX2Q70Z35 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
PREX2Q70Z35 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
PREX2Q70Z35 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
PREX2Q70Z35 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
PREX2Q70Z35 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
PREX2Q70Z35 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
PREX2Q70Z35 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
PREX2Q70Z35 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
PREX2Q70Z35 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
PREX2Q70Z35 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
PREX2Q70Z35 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
PREX2Q70Z35 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
PREX2Q70Z35 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
PREX2Q70Z35 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
PREX2Q70Z35 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
PREX2Q70Z35 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.72■■■■■ 4.59
PREX2Q70Z35 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
PREX2Q70Z35 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
PREX2Q70Z35 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
PREX2Q70Z35 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
PREX2Q70Z35 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
PREX2Q70Z35 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
PREX2Q70Z35 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
PREX2Q70Z35 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
PREX2Q70Z35 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
PREX2Q70Z35 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
PREX2Q70Z35 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
PREX2Q70Z35 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
PREX2Q70Z35 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
PREX2Q70Z35 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
PREX2Q70Z35 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
PREX2Q70Z35 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
PREX2Q70Z35 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
PREX2Q70Z35 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
PREX2Q70Z35 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
PREX2Q70Z35 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
PREX2Q70Z35 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
PREX2Q70Z35 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms