Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
NUP188Q5SRE5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
NUP188Q5SRE5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
NUP188Q5SRE5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
NUP188Q5SRE5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
NUP188Q5SRE5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NUP188Q5SRE5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NUP188Q5SRE5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NUP188Q5SRE5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
NUP188Q5SRE5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NUP188Q5SRE5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
NUP188Q5SRE5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NUP188Q5SRE5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
NUP188Q5SRE5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NUP188Q5SRE5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NUP188Q5SRE5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
NUP188Q5SRE5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
NUP188Q5SRE5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NUP188Q5SRE5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NUP188Q5SRE5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
NUP188Q5SRE5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
NUP188Q5SRE5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
NUP188Q5SRE5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NUP188Q5SRE5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NUP188Q5SRE5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NUP188Q5SRE5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NUP188Q5SRE5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NUP188Q5SRE5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
NUP188Q5SRE5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NUP188Q5SRE5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
NUP188Q5SRE5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NUP188Q5SRE5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NUP188Q5SRE5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NUP188Q5SRE5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NUP188Q5SRE5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NUP188Q5SRE5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NUP188Q5SRE5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NUP188Q5SRE5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
NUP188Q5SRE5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
NUP188Q5SRE5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NUP188Q5SRE5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NUP188Q5SRE5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NUP188Q5SRE5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NUP188Q5SRE5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NUP188Q5SRE5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NUP188Q5SRE5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NUP188Q5SRE5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NUP188Q5SRE5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NUP188Q5SRE5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NUP188Q5SRE5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NUP188Q5SRE5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NUP188Q5SRE5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NUP188Q5SRE5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NUP188Q5SRE5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NUP188Q5SRE5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NUP188Q5SRE5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NUP188Q5SRE5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NUP188Q5SRE5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
NUP188Q5SRE5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NUP188Q5SRE5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NUP188Q5SRE5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NUP188Q5SRE5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NUP188Q5SRE5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NUP188Q5SRE5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NUP188Q5SRE5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NUP188Q5SRE5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NUP188Q5SRE5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NUP188Q5SRE5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NUP188Q5SRE5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
NUP188Q5SRE5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
NUP188Q5SRE5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NUP188Q5SRE5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
NUP188Q5SRE5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NUP188Q5SRE5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
NUP188Q5SRE5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
NUP188Q5SRE5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NUP188Q5SRE5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NUP188Q5SRE5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NUP188Q5SRE5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NUP188Q5SRE5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NUP188Q5SRE5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NUP188Q5SRE5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NUP188Q5SRE5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NUP188Q5SRE5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NUP188Q5SRE5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NUP188Q5SRE5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NUP188Q5SRE5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
NUP188Q5SRE5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUP188Q5SRE5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUP188Q5SRE5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
NUP188Q5SRE5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP188Q5SRE5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUP188Q5SRE5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NUP188Q5SRE5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NUP188Q5SRE5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NUP188Q5SRE5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NUP188Q5SRE5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NUP188Q5SRE5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NUP188Q5SRE5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NUP188Q5SRE5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms