Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C5orf47Q569G3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C5orf47Q569G3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C5orf47Q569G3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C5orf47Q569G3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C5orf47Q569G3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C5orf47Q569G3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C5orf47Q569G3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C5orf47Q569G3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf47Q569G3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf47Q569G3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C5orf47Q569G3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C5orf47Q569G3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf47Q569G3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf47Q569G3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf47Q569G3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf47Q569G3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C5orf47Q569G3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C5orf47Q569G3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C5orf47Q569G3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C5orf47Q569G3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C5orf47Q569G3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C5orf47Q569G3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C5orf47Q569G3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C5orf47Q569G3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C5orf47Q569G3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C5orf47Q569G3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C5orf47Q569G3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C5orf47Q569G3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C5orf47Q569G3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C5orf47Q569G3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C5orf47Q569G3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C5orf47Q569G3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C5orf47Q569G3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C5orf47Q569G3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C5orf47Q569G3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C5orf47Q569G3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C5orf47Q569G3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C5orf47Q569G3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C5orf47Q569G3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C5orf47Q569G3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C5orf47Q569G3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C5orf47Q569G3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C5orf47Q569G3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C5orf47Q569G3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C5orf47Q569G3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C5orf47Q569G3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C5orf47Q569G3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf47Q569G3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf47Q569G3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf47Q569G3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf47Q569G3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf47Q569G3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf47Q569G3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf47Q569G3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf47Q569G3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf47Q569G3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C5orf47Q569G3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C5orf47Q569G3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C5orf47Q569G3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C5orf47Q569G3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf47Q569G3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf47Q569G3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C5orf47Q569G3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C5orf47Q569G3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf47Q569G3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf47Q569G3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf47Q569G3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C5orf47Q569G3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C5orf47Q569G3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C5orf47Q569G3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C5orf47Q569G3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf47Q569G3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf47Q569G3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf47Q569G3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf47Q569G3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf47Q569G3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf47Q569G3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf47Q569G3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf47Q569G3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf47Q569G3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf47Q569G3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf47Q569G3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf47Q569G3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf47Q569G3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf47Q569G3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf47Q569G3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf47Q569G3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf47Q569G3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf47Q569G3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf47Q569G3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf47Q569G3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf47Q569G3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf47Q569G3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf47Q569G3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf47Q569G3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf47Q569G3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf47Q569G3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf47Q569G3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C5orf47Q569G3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms