Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC92Q53HC0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC92Q53HC0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC92Q53HC0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC92Q53HC0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC92Q53HC0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC92Q53HC0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC92Q53HC0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC92Q53HC0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC92Q53HC0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC92Q53HC0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC92Q53HC0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC92Q53HC0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC92Q53HC0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC92Q53HC0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC92Q53HC0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC92Q53HC0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC92Q53HC0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC92Q53HC0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC92Q53HC0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC92Q53HC0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC92Q53HC0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC92Q53HC0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC92Q53HC0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC92Q53HC0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC92Q53HC0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC92Q53HC0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC92Q53HC0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC92Q53HC0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC92Q53HC0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC92Q53HC0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC92Q53HC0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC92Q53HC0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC92Q53HC0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC92Q53HC0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC92Q53HC0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC92Q53HC0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC92Q53HC0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC92Q53HC0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC92Q53HC0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC92Q53HC0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC92Q53HC0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC92Q53HC0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC92Q53HC0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC92Q53HC0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC92Q53HC0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC92Q53HC0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC92Q53HC0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC92Q53HC0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC92Q53HC0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC92Q53HC0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC92Q53HC0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC92Q53HC0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC92Q53HC0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC92Q53HC0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC92Q53HC0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC92Q53HC0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC92Q53HC0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC92Q53HC0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC92Q53HC0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC92Q53HC0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC92Q53HC0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC92Q53HC0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC92Q53HC0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC92Q53HC0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC92Q53HC0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC92Q53HC0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC92Q53HC0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC92Q53HC0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC92Q53HC0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC92Q53HC0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC92Q53HC0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC92Q53HC0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC92Q53HC0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC92Q53HC0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC92Q53HC0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC92Q53HC0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC92Q53HC0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC92Q53HC0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC92Q53HC0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC92Q53HC0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC92Q53HC0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC92Q53HC0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC92Q53HC0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC92Q53HC0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC92Q53HC0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC92Q53HC0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC92Q53HC0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC92Q53HC0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC92Q53HC0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC92Q53HC0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC92Q53HC0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC92Q53HC0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC92Q53HC0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC92Q53HC0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC92Q53HC0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC92Q53HC0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC92Q53HC0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC92Q53HC0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC92Q53HC0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms