Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C4orf17Q53FE4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
C4orf17Q53FE4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4orf17Q53FE4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4orf17Q53FE4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
C4orf17Q53FE4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4orf17Q53FE4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C4orf17Q53FE4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C4orf17Q53FE4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C4orf17Q53FE4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C4orf17Q53FE4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C4orf17Q53FE4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
C4orf17Q53FE4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4orf17Q53FE4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4orf17Q53FE4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4orf17Q53FE4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4orf17Q53FE4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
C4orf17Q53FE4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4orf17Q53FE4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4orf17Q53FE4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
C4orf17Q53FE4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4orf17Q53FE4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4orf17Q53FE4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4orf17Q53FE4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4orf17Q53FE4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4orf17Q53FE4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4orf17Q53FE4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4orf17Q53FE4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C4orf17Q53FE4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4orf17Q53FE4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4orf17Q53FE4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C4orf17Q53FE4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C4orf17Q53FE4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
C4orf17Q53FE4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C4orf17Q53FE4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C4orf17Q53FE4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C4orf17Q53FE4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
C4orf17Q53FE4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
C4orf17Q53FE4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C4orf17Q53FE4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
C4orf17Q53FE4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C4orf17Q53FE4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C4orf17Q53FE4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C4orf17Q53FE4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C4orf17Q53FE4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4orf17Q53FE4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4orf17Q53FE4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4orf17Q53FE4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4orf17Q53FE4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4orf17Q53FE4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4orf17Q53FE4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4orf17Q53FE4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4orf17Q53FE4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4orf17Q53FE4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C4orf17Q53FE4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C4orf17Q53FE4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C4orf17Q53FE4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C4orf17Q53FE4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C4orf17Q53FE4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C4orf17Q53FE4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C4orf17Q53FE4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C4orf17Q53FE4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C4orf17Q53FE4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C4orf17Q53FE4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C4orf17Q53FE4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C4orf17Q53FE4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C4orf17Q53FE4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C4orf17Q53FE4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C4orf17Q53FE4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C4orf17Q53FE4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C4orf17Q53FE4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C4orf17Q53FE4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4orf17Q53FE4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4orf17Q53FE4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
C4orf17Q53FE4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C4orf17Q53FE4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C4orf17Q53FE4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C4orf17Q53FE4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4orf17Q53FE4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C4orf17Q53FE4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
C4orf17Q53FE4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C4orf17Q53FE4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C4orf17Q53FE4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4orf17Q53FE4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4orf17Q53FE4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4orf17Q53FE4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4orf17Q53FE4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4orf17Q53FE4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf17Q53FE4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf17Q53FE4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4orf17Q53FE4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4orf17Q53FE4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4orf17Q53FE4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4orf17Q53FE4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C4orf17Q53FE4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C4orf17Q53FE4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4orf17Q53FE4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf17Q53FE4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf17Q53FE4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf17Q53FE4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms