Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SVEP1Q4LDE5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SVEP1Q4LDE5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SVEP1Q4LDE5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SVEP1Q4LDE5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SVEP1Q4LDE5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SVEP1Q4LDE5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SVEP1Q4LDE5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SVEP1Q4LDE5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SVEP1Q4LDE5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SVEP1Q4LDE5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SVEP1Q4LDE5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SVEP1Q4LDE5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SVEP1Q4LDE5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SVEP1Q4LDE5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SVEP1Q4LDE5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SVEP1Q4LDE5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SVEP1Q4LDE5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SVEP1Q4LDE5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SVEP1Q4LDE5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SVEP1Q4LDE5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SVEP1Q4LDE5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SVEP1Q4LDE5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SVEP1Q4LDE5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SVEP1Q4LDE5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SVEP1Q4LDE5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SVEP1Q4LDE5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SVEP1Q4LDE5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SVEP1Q4LDE5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SVEP1Q4LDE5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SVEP1Q4LDE5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SVEP1Q4LDE5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SVEP1Q4LDE5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SVEP1Q4LDE5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SVEP1Q4LDE5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SVEP1Q4LDE5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SVEP1Q4LDE5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SVEP1Q4LDE5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SVEP1Q4LDE5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SVEP1Q4LDE5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SVEP1Q4LDE5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SVEP1Q4LDE5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SVEP1Q4LDE5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SVEP1Q4LDE5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SVEP1Q4LDE5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SVEP1Q4LDE5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SVEP1Q4LDE5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SVEP1Q4LDE5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SVEP1Q4LDE5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SVEP1Q4LDE5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SVEP1Q4LDE5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SVEP1Q4LDE5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SVEP1Q4LDE5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SVEP1Q4LDE5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SVEP1Q4LDE5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SVEP1Q4LDE5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SVEP1Q4LDE5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SVEP1Q4LDE5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SVEP1Q4LDE5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SVEP1Q4LDE5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SVEP1Q4LDE5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SVEP1Q4LDE5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SVEP1Q4LDE5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SVEP1Q4LDE5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SVEP1Q4LDE5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SVEP1Q4LDE5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SVEP1Q4LDE5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SVEP1Q4LDE5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SVEP1Q4LDE5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SVEP1Q4LDE5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SVEP1Q4LDE5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SVEP1Q4LDE5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SVEP1Q4LDE5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SVEP1Q4LDE5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SVEP1Q4LDE5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SVEP1Q4LDE5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SVEP1Q4LDE5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SVEP1Q4LDE5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SVEP1Q4LDE5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SVEP1Q4LDE5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SVEP1Q4LDE5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SVEP1Q4LDE5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SVEP1Q4LDE5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SVEP1Q4LDE5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SVEP1Q4LDE5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SVEP1Q4LDE5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SVEP1Q4LDE5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SVEP1Q4LDE5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SVEP1Q4LDE5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SVEP1Q4LDE5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SVEP1Q4LDE5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SVEP1Q4LDE5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SVEP1Q4LDE5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SVEP1Q4LDE5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SVEP1Q4LDE5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SVEP1Q4LDE5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SVEP1Q4LDE5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SVEP1Q4LDE5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SVEP1Q4LDE5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SVEP1Q4LDE5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms