Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ8

TMEM249, Transmembrane protein 249, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM249Q2WGJ8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM249Q2WGJ8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM249Q2WGJ8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM249Q2WGJ8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM249Q2WGJ8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM249Q2WGJ8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM249Q2WGJ8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM249Q2WGJ8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM249Q2WGJ8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM249Q2WGJ8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM249Q2WGJ8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM249Q2WGJ8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM249Q2WGJ8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM249Q2WGJ8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM249Q2WGJ8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM249Q2WGJ8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM249Q2WGJ8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM249Q2WGJ8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM249Q2WGJ8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM249Q2WGJ8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM249Q2WGJ8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM249Q2WGJ8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM249Q2WGJ8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM249Q2WGJ8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM249Q2WGJ8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM249Q2WGJ8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM249Q2WGJ8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM249Q2WGJ8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM249Q2WGJ8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM249Q2WGJ8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM249Q2WGJ8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM249Q2WGJ8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM249Q2WGJ8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM249Q2WGJ8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM249Q2WGJ8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM249Q2WGJ8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM249Q2WGJ8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM249Q2WGJ8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM249Q2WGJ8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM249Q2WGJ8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM249Q2WGJ8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM249Q2WGJ8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM249Q2WGJ8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM249Q2WGJ8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM249Q2WGJ8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM249Q2WGJ8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM249Q2WGJ8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM249Q2WGJ8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM249Q2WGJ8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM249Q2WGJ8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM249Q2WGJ8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM249Q2WGJ8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM249Q2WGJ8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM249Q2WGJ8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM249Q2WGJ8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM249Q2WGJ8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM249Q2WGJ8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM249Q2WGJ8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM249Q2WGJ8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM249Q2WGJ8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM249Q2WGJ8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM249Q2WGJ8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM249Q2WGJ8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM249Q2WGJ8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM249Q2WGJ8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM249Q2WGJ8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM249Q2WGJ8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM249Q2WGJ8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM249Q2WGJ8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM249Q2WGJ8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM249Q2WGJ8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM249Q2WGJ8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM249Q2WGJ8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM249Q2WGJ8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM249Q2WGJ8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM249Q2WGJ8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM249Q2WGJ8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM249Q2WGJ8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM249Q2WGJ8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM249Q2WGJ8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM249Q2WGJ8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM249Q2WGJ8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM249Q2WGJ8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM249Q2WGJ8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM249Q2WGJ8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM249Q2WGJ8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM249Q2WGJ8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM249Q2WGJ8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM249Q2WGJ8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM249Q2WGJ8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM249Q2WGJ8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM249Q2WGJ8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM249Q2WGJ8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM249Q2WGJ8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM249Q2WGJ8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM249Q2WGJ8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM249Q2WGJ8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM249Q2WGJ8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM249Q2WGJ8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM249Q2WGJ8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms