Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ITSN1Q15811 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ITSN1Q15811 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ITSN1Q15811 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
ITSN1Q15811 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ITSN1Q15811 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ITSN1Q15811 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ITSN1Q15811 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
ITSN1Q15811 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
ITSN1Q15811 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
ITSN1Q15811 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ITSN1Q15811 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ITSN1Q15811 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ITSN1Q15811 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ITSN1Q15811 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
ITSN1Q15811 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ITSN1Q15811 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
ITSN1Q15811 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ITSN1Q15811 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ITSN1Q15811 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
ITSN1Q15811 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ITSN1Q15811 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ITSN1Q15811 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
ITSN1Q15811 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ITSN1Q15811 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ITSN1Q15811 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
ITSN1Q15811 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
ITSN1Q15811 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ITSN1Q15811 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ITSN1Q15811 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
ITSN1Q15811 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ITSN1Q15811 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
ITSN1Q15811 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC40.01■■■■■ 4
ITSN1Q15811 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
ITSN1Q15811 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC40■■■■□ 3.99
ITSN1Q15811 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
ITSN1Q15811 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ITSN1Q15811 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
ITSN1Q15811 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
ITSN1Q15811 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ITSN1Q15811 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
ITSN1Q15811 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
ITSN1Q15811 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
ITSN1Q15811 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
ITSN1Q15811 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
ITSN1Q15811 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
ITSN1Q15811 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ITSN1Q15811 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
ITSN1Q15811 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
ITSN1Q15811 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
ITSN1Q15811 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
ITSN1Q15811 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
ITSN1Q15811 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
ITSN1Q15811 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
ITSN1Q15811 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
ITSN1Q15811 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
ITSN1Q15811 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
ITSN1Q15811 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
ITSN1Q15811 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
ITSN1Q15811 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
ITSN1Q15811 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
ITSN1Q15811 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ITSN1Q15811 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ITSN1Q15811 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.53■■■■□ 3.92
ITSN1Q15811 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
ITSN1Q15811 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.91
ITSN1Q15811 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ITSN1Q15811 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ITSN1Q15811 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
ITSN1Q15811 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
ITSN1Q15811 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
ITSN1Q15811 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ITSN1Q15811 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
ITSN1Q15811 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
ITSN1Q15811 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ITSN1Q15811 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
ITSN1Q15811 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
ITSN1Q15811 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ITSN1Q15811 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
ITSN1Q15811 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
ITSN1Q15811 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
ITSN1Q15811 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ITSN1Q15811 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ITSN1Q15811 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ITSN1Q15811 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ITSN1Q15811 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ITSN1Q15811 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
ITSN1Q15811 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ITSN1Q15811 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ITSN1Q15811 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
ITSN1Q15811 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ITSN1Q15811 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ITSN1Q15811 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
ITSN1Q15811 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ITSN1Q15811 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ITSN1Q15811 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ITSN1Q15811 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ITSN1Q15811 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
ITSN1Q15811 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
ITSN1Q15811 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
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