Protein–RNA interactions for Protein: Q14152

EIF3A, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3AQ14152 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
EIF3AQ14152 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
EIF3AQ14152 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
EIF3AQ14152 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
EIF3AQ14152 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
EIF3AQ14152 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
EIF3AQ14152 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
EIF3AQ14152 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
EIF3AQ14152 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
EIF3AQ14152 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
EIF3AQ14152 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
EIF3AQ14152 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.87■■■■■ 4.13
EIF3AQ14152 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
EIF3AQ14152 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
EIF3AQ14152 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
EIF3AQ14152 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
EIF3AQ14152 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
EIF3AQ14152 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
EIF3AQ14152 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
EIF3AQ14152 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
EIF3AQ14152 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
EIF3AQ14152 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
EIF3AQ14152 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
EIF3AQ14152 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
EIF3AQ14152 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
EIF3AQ14152 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
EIF3AQ14152 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
EIF3AQ14152 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
EIF3AQ14152 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
EIF3AQ14152 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
EIF3AQ14152 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
EIF3AQ14152 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
EIF3AQ14152 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
EIF3AQ14152 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
EIF3AQ14152 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
EIF3AQ14152 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
EIF3AQ14152 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
EIF3AQ14152 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
EIF3AQ14152 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
EIF3AQ14152 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
EIF3AQ14152 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
EIF3AQ14152 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
EIF3AQ14152 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
EIF3AQ14152 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
EIF3AQ14152 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
EIF3AQ14152 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
EIF3AQ14152 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
EIF3AQ14152 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
EIF3AQ14152 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
EIF3AQ14152 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
EIF3AQ14152 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
EIF3AQ14152 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
EIF3AQ14152 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
EIF3AQ14152 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC40.23■■■■■ 4.03
EIF3AQ14152 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
EIF3AQ14152 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
EIF3AQ14152 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
EIF3AQ14152 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
EIF3AQ14152 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
EIF3AQ14152 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
EIF3AQ14152 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
EIF3AQ14152 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
EIF3AQ14152 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
EIF3AQ14152 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC40.06■■■■■ 4
EIF3AQ14152 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC40.05■■■■■ 4
EIF3AQ14152 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC40.05■■■■■ 4
EIF3AQ14152 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
EIF3AQ14152 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
EIF3AQ14152 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
EIF3AQ14152 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
EIF3AQ14152 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
EIF3AQ14152 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
EIF3AQ14152 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
EIF3AQ14152 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
EIF3AQ14152 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
EIF3AQ14152 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
EIF3AQ14152 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
EIF3AQ14152 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
EIF3AQ14152 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
EIF3AQ14152 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
EIF3AQ14152 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
EIF3AQ14152 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
EIF3AQ14152 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
EIF3AQ14152 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
EIF3AQ14152 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
EIF3AQ14152 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
EIF3AQ14152 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.78■■■■□ 3.96
EIF3AQ14152 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.76■■■■□ 3.96
EIF3AQ14152 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
EIF3AQ14152 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
EIF3AQ14152 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
EIF3AQ14152 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
EIF3AQ14152 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
EIF3AQ14152 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
EIF3AQ14152 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
EIF3AQ14152 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
EIF3AQ14152 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
EIF3AQ14152 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
EIF3AQ14152 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
EIF3AQ14152 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms