Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SMAD4Q13485 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SMAD4Q13485 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SMAD4Q13485 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SMAD4Q13485 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SMAD4Q13485 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SMAD4Q13485 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SMAD4Q13485 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SMAD4Q13485 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SMAD4Q13485 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SMAD4Q13485 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMAD4Q13485 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMAD4Q13485 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMAD4Q13485 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMAD4Q13485 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SMAD4Q13485 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMAD4Q13485 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMAD4Q13485 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SMAD4Q13485 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SMAD4Q13485 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMAD4Q13485 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SMAD4Q13485 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMAD4Q13485 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SMAD4Q13485 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SMAD4Q13485 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SMAD4Q13485 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SMAD4Q13485 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SMAD4Q13485 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SMAD4Q13485 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SMAD4Q13485 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SMAD4Q13485 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SMAD4Q13485 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SMAD4Q13485 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SMAD4Q13485 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SMAD4Q13485 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMAD4Q13485 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMAD4Q13485 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMAD4Q13485 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMAD4Q13485 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMAD4Q13485 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMAD4Q13485 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMAD4Q13485 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMAD4Q13485 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMAD4Q13485 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMAD4Q13485 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMAD4Q13485 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMAD4Q13485 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMAD4Q13485 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMAD4Q13485 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMAD4Q13485 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMAD4Q13485 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMAD4Q13485 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMAD4Q13485 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMAD4Q13485 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SMAD4Q13485 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMAD4Q13485 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMAD4Q13485 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMAD4Q13485 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SMAD4Q13485 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SMAD4Q13485 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SMAD4Q13485 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMAD4Q13485 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMAD4Q13485 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SMAD4Q13485 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMAD4Q13485 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMAD4Q13485 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SMAD4Q13485 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMAD4Q13485 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SMAD4Q13485 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMAD4Q13485 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMAD4Q13485 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMAD4Q13485 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMAD4Q13485 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMAD4Q13485 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMAD4Q13485 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMAD4Q13485 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SMAD4Q13485 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMAD4Q13485 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMAD4Q13485 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMAD4Q13485 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMAD4Q13485 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMAD4Q13485 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SMAD4Q13485 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMAD4Q13485 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMAD4Q13485 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMAD4Q13485 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMAD4Q13485 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMAD4Q13485 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMAD4Q13485 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMAD4Q13485 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMAD4Q13485 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMAD4Q13485 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMAD4Q13485 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SMAD4Q13485 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMAD4Q13485 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SMAD4Q13485 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMAD4Q13485 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMAD4Q13485 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMAD4Q13485 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SMAD4Q13485 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
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