Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MKRN4PQ13434 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MKRN4PQ13434 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MKRN4PQ13434 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MKRN4PQ13434 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MKRN4PQ13434 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MKRN4PQ13434 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MKRN4PQ13434 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
MKRN4PQ13434 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MKRN4PQ13434 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MKRN4PQ13434 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MKRN4PQ13434 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MKRN4PQ13434 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MKRN4PQ13434 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MKRN4PQ13434 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MKRN4PQ13434 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MKRN4PQ13434 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MKRN4PQ13434 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MKRN4PQ13434 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MKRN4PQ13434 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MKRN4PQ13434 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MKRN4PQ13434 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MKRN4PQ13434 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MKRN4PQ13434 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MKRN4PQ13434 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
MKRN4PQ13434 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MKRN4PQ13434 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MKRN4PQ13434 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MKRN4PQ13434 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
MKRN4PQ13434 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
MKRN4PQ13434 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MKRN4PQ13434 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MKRN4PQ13434 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MKRN4PQ13434 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MKRN4PQ13434 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MKRN4PQ13434 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MKRN4PQ13434 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MKRN4PQ13434 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
MKRN4PQ13434 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
MKRN4PQ13434 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MKRN4PQ13434 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
MKRN4PQ13434 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MKRN4PQ13434 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
MKRN4PQ13434 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MKRN4PQ13434 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MKRN4PQ13434 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MKRN4PQ13434 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MKRN4PQ13434 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MKRN4PQ13434 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MKRN4PQ13434 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MKRN4PQ13434 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MKRN4PQ13434 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MKRN4PQ13434 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
MKRN4PQ13434 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MKRN4PQ13434 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MKRN4PQ13434 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MKRN4PQ13434 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MKRN4PQ13434 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MKRN4PQ13434 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MKRN4PQ13434 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MKRN4PQ13434 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MKRN4PQ13434 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MKRN4PQ13434 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MKRN4PQ13434 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
MKRN4PQ13434 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MKRN4PQ13434 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
MKRN4PQ13434 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
MKRN4PQ13434 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
MKRN4PQ13434 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
MKRN4PQ13434 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MKRN4PQ13434 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MKRN4PQ13434 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
MKRN4PQ13434 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MKRN4PQ13434 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
MKRN4PQ13434 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
MKRN4PQ13434 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
MKRN4PQ13434 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
MKRN4PQ13434 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
MKRN4PQ13434 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
MKRN4PQ13434 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
MKRN4PQ13434 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MKRN4PQ13434 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MKRN4PQ13434 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
MKRN4PQ13434 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MKRN4PQ13434 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MKRN4PQ13434 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
MKRN4PQ13434 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MKRN4PQ13434 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MKRN4PQ13434 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
MKRN4PQ13434 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
MKRN4PQ13434 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MKRN4PQ13434 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MKRN4PQ13434 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
MKRN4PQ13434 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
MKRN4PQ13434 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MKRN4PQ13434 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MKRN4PQ13434 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MKRN4PQ13434 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MKRN4PQ13434 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MKRN4PQ13434 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
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