Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRPL49Q13405 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPL49Q13405 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL49Q13405 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL49Q13405 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL49Q13405 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL49Q13405 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL49Q13405 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRPL49Q13405 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRPL49Q13405 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRPL49Q13405 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRPL49Q13405 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL49Q13405 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL49Q13405 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL49Q13405 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL49Q13405 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL49Q13405 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MRPL49Q13405 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MRPL49Q13405 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL49Q13405 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL49Q13405 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL49Q13405 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL49Q13405 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL49Q13405 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL49Q13405 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL49Q13405 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL49Q13405 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL49Q13405 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL49Q13405 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL49Q13405 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL49Q13405 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL49Q13405 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL49Q13405 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL49Q13405 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL49Q13405 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL49Q13405 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL49Q13405 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL49Q13405 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL49Q13405 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL49Q13405 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL49Q13405 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPL49Q13405 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL49Q13405 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL49Q13405 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPL49Q13405 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL49Q13405 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL49Q13405 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL49Q13405 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL49Q13405 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL49Q13405 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL49Q13405 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPL49Q13405 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPL49Q13405 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPL49Q13405 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL49Q13405 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPL49Q13405 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL49Q13405 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL49Q13405 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL49Q13405 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL49Q13405 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL49Q13405 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL49Q13405 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPL49Q13405 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL49Q13405 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL49Q13405 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL49Q13405 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL49Q13405 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL49Q13405 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL49Q13405 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL49Q13405 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL49Q13405 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL49Q13405 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL49Q13405 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
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