Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRSQ13332 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRSQ13332 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRSQ13332 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRSQ13332 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRSQ13332 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRSQ13332 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRSQ13332 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRSQ13332 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRSQ13332 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRSQ13332 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRSQ13332 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRSQ13332 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRSQ13332 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRSQ13332 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRSQ13332 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRSQ13332 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRSQ13332 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRSQ13332 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRSQ13332 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRSQ13332 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRSQ13332 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRSQ13332 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRSQ13332 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRSQ13332 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRSQ13332 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRSQ13332 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRSQ13332 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRSQ13332 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRSQ13332 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRSQ13332 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRSQ13332 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRSQ13332 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRSQ13332 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRSQ13332 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRSQ13332 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRSQ13332 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRSQ13332 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRSQ13332 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRSQ13332 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRSQ13332 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRSQ13332 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PTPRSQ13332 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRSQ13332 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRSQ13332 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRSQ13332 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRSQ13332 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRSQ13332 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRSQ13332 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRSQ13332 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRSQ13332 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRSQ13332 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRSQ13332 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRSQ13332 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRSQ13332 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRSQ13332 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRSQ13332 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRSQ13332 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRSQ13332 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRSQ13332 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRSQ13332 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRSQ13332 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRSQ13332 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRSQ13332 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRSQ13332 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRSQ13332 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRSQ13332 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRSQ13332 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRSQ13332 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRSQ13332 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRSQ13332 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRSQ13332 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRSQ13332 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRSQ13332 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRSQ13332 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRSQ13332 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRSQ13332 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRSQ13332 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRSQ13332 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRSQ13332 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRSQ13332 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRSQ13332 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRSQ13332 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRSQ13332 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRSQ13332 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRSQ13332 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRSQ13332 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRSQ13332 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRSQ13332 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRSQ13332 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRSQ13332 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRSQ13332 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRSQ13332 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRSQ13332 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRSQ13332 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRSQ13332 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRSQ13332 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRSQ13332 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRSQ13332 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRSQ13332 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
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