Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC49.72■■■■■ 5.55
GRIN2BQ13224 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.68■■■■■ 5.54
GRIN2BQ13224 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
GRIN2BQ13224 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC49.67■■■■■ 5.54
GRIN2BQ13224 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC49.58■■■■■ 5.53
GRIN2BQ13224 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC49.55■■■■■ 5.52
GRIN2BQ13224 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
GRIN2BQ13224 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC49.5■■■■■ 5.51
GRIN2BQ13224 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC49.42■■■■■ 5.5
GRIN2BQ13224 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC49.41■■■■■ 5.5
GRIN2BQ13224 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC49.41■■■■■ 5.5
GRIN2BQ13224 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
GRIN2BQ13224 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.3■■■■■ 5.48
GRIN2BQ13224 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.48
GRIN2BQ13224 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.22■■■■■ 5.47
GRIN2BQ13224 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.17■■■■■ 5.46
GRIN2BQ13224 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC49.16■■■■■ 5.46
GRIN2BQ13224 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
GRIN2BQ13224 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC49.06■■■■■ 5.44
GRIN2BQ13224 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC49.05■■■■■ 5.44
GRIN2BQ13224 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC49.04■■■■■ 5.44
GRIN2BQ13224 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
GRIN2BQ13224 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.44
GRIN2BQ13224 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.92■■■■■ 5.42
GRIN2BQ13224 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC48.89■■■■■ 5.42
GRIN2BQ13224 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
GRIN2BQ13224 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC48.86■■■■■ 5.41
GRIN2BQ13224 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
GRIN2BQ13224 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC48.85■■■■■ 5.41
GRIN2BQ13224 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
GRIN2BQ13224 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC48.84■■■■■ 5.41
GRIN2BQ13224 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC48.81■■■■■ 5.4
GRIN2BQ13224 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
GRIN2BQ13224 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC48.74■■■■■ 5.39
GRIN2BQ13224 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC48.73■■■■■ 5.39
GRIN2BQ13224 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
GRIN2BQ13224 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC48.72■■■■■ 5.39
GRIN2BQ13224 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC48.61■■■■■ 5.37
GRIN2BQ13224 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC48.61■■■■■ 5.37
GRIN2BQ13224 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
GRIN2BQ13224 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
GRIN2BQ13224 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
GRIN2BQ13224 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC48.57■■■■■ 5.37
GRIN2BQ13224 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
GRIN2BQ13224 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.53■■■■■ 5.36
GRIN2BQ13224 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC48.51■■■■■ 5.36
GRIN2BQ13224 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC48.51■■■■■ 5.36
GRIN2BQ13224 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC48.48■■■■■ 5.35
GRIN2BQ13224 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.47■■■■■ 5.35
GRIN2BQ13224 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.46■■■■■ 5.35
GRIN2BQ13224 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC48.46■■■■■ 5.35
GRIN2BQ13224 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC48.41■■■■■ 5.34
GRIN2BQ13224 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC48.41■■■■■ 5.34
GRIN2BQ13224 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.38■■■■■ 5.34
GRIN2BQ13224 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
GRIN2BQ13224 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
GRIN2BQ13224 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC48.24■■■■■ 5.31
GRIN2BQ13224 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
GRIN2BQ13224 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC48.21■■■■■ 5.31
GRIN2BQ13224 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
GRIN2BQ13224 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
GRIN2BQ13224 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
GRIN2BQ13224 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC48.08■■■■■ 5.29
GRIN2BQ13224 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC48.07■■■■■ 5.29
GRIN2BQ13224 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC48.07■■■■■ 5.29
GRIN2BQ13224 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC48.05■■■■■ 5.28
GRIN2BQ13224 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.04■■■■■ 5.28
GRIN2BQ13224 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.01■■■■■ 5.28
GRIN2BQ13224 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
GRIN2BQ13224 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
GRIN2BQ13224 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC47.92■■■■■ 5.26
GRIN2BQ13224 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
GRIN2BQ13224 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.86■■■■■ 5.25
GRIN2BQ13224 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
GRIN2BQ13224 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
GRIN2BQ13224 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
GRIN2BQ13224 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC47.79■■■■■ 5.24
GRIN2BQ13224 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
GRIN2BQ13224 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.76■■■■■ 5.24
GRIN2BQ13224 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC47.76■■■■■ 5.24
GRIN2BQ13224 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC47.74■■■■■ 5.23
GRIN2BQ13224 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
GRIN2BQ13224 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.69■■■■■ 5.22
GRIN2BQ13224 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
GRIN2BQ13224 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC47.67■■■■■ 5.22
GRIN2BQ13224 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
GRIN2BQ13224 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC47.64■■■■■ 5.22
GRIN2BQ13224 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC47.63■■■■■ 5.22
GRIN2BQ13224 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
GRIN2BQ13224 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
GRIN2BQ13224 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.61■■■■■ 5.21
GRIN2BQ13224 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC47.6■■■■■ 5.21
GRIN2BQ13224 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
GRIN2BQ13224 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC47.58■■■■■ 5.21
GRIN2BQ13224 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC47.57■■■■■ 5.21
GRIN2BQ13224 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
GRIN2BQ13224 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.2
GRIN2BQ13224 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC47.56■■■■■ 5.2
GRIN2BQ13224 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
GRIN2BQ13224 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC47.53■■■■■ 5.2
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