Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDD7

C19orf57, Uncharacterized protein C19orf57, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf57Q0VDD7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C19orf57Q0VDD7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C19orf57Q0VDD7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C19orf57Q0VDD7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C19orf57Q0VDD7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C19orf57Q0VDD7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C19orf57Q0VDD7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.55■■■□□ 2
C19orf57Q0VDD7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C19orf57Q0VDD7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C19orf57Q0VDD7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C19orf57Q0VDD7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C19orf57Q0VDD7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C19orf57Q0VDD7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C19orf57Q0VDD7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C19orf57Q0VDD7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C19orf57Q0VDD7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C19orf57Q0VDD7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
C19orf57Q0VDD7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
C19orf57Q0VDD7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C19orf57Q0VDD7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C19orf57Q0VDD7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C19orf57Q0VDD7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C19orf57Q0VDD7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C19orf57Q0VDD7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C19orf57Q0VDD7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C19orf57Q0VDD7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C19orf57Q0VDD7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C19orf57Q0VDD7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C19orf57Q0VDD7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C19orf57Q0VDD7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C19orf57Q0VDD7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
C19orf57Q0VDD7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C19orf57Q0VDD7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C19orf57Q0VDD7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C19orf57Q0VDD7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
C19orf57Q0VDD7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C19orf57Q0VDD7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C19orf57Q0VDD7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C19orf57Q0VDD7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C19orf57Q0VDD7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C19orf57Q0VDD7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
C19orf57Q0VDD7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C19orf57Q0VDD7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C19orf57Q0VDD7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C19orf57Q0VDD7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C19orf57Q0VDD7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C19orf57Q0VDD7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
C19orf57Q0VDD7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C19orf57Q0VDD7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C19orf57Q0VDD7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C19orf57Q0VDD7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C19orf57Q0VDD7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
C19orf57Q0VDD7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C19orf57Q0VDD7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C19orf57Q0VDD7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C19orf57Q0VDD7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C19orf57Q0VDD7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C19orf57Q0VDD7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C19orf57Q0VDD7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C19orf57Q0VDD7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
C19orf57Q0VDD7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C19orf57Q0VDD7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C19orf57Q0VDD7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C19orf57Q0VDD7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C19orf57Q0VDD7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
C19orf57Q0VDD7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
C19orf57Q0VDD7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C19orf57Q0VDD7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
C19orf57Q0VDD7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C19orf57Q0VDD7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C19orf57Q0VDD7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C19orf57Q0VDD7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C19orf57Q0VDD7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C19orf57Q0VDD7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C19orf57Q0VDD7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C19orf57Q0VDD7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C19orf57Q0VDD7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C19orf57Q0VDD7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C19orf57Q0VDD7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C19orf57Q0VDD7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C19orf57Q0VDD7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C19orf57Q0VDD7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C19orf57Q0VDD7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C19orf57Q0VDD7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C19orf57Q0VDD7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C19orf57Q0VDD7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C19orf57Q0VDD7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C19orf57Q0VDD7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C19orf57Q0VDD7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C19orf57Q0VDD7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C19orf57Q0VDD7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C19orf57Q0VDD7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C19orf57Q0VDD7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C19orf57Q0VDD7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C19orf57Q0VDD7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C19orf57Q0VDD7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C19orf57Q0VDD7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C19orf57Q0VDD7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C19orf57Q0VDD7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C19orf57Q0VDD7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms