Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DSC1Q08554 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
DSC1Q08554 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
DSC1Q08554 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DSC1Q08554 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DSC1Q08554 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
DSC1Q08554 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
DSC1Q08554 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DSC1Q08554 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
DSC1Q08554 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
DSC1Q08554 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
DSC1Q08554 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
DSC1Q08554 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
DSC1Q08554 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DSC1Q08554 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DSC1Q08554 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DSC1Q08554 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DSC1Q08554 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DSC1Q08554 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DSC1Q08554 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
DSC1Q08554 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DSC1Q08554 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
DSC1Q08554 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DSC1Q08554 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
DSC1Q08554 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DSC1Q08554 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
DSC1Q08554 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DSC1Q08554 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DSC1Q08554 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DSC1Q08554 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DSC1Q08554 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DSC1Q08554 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DSC1Q08554 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DSC1Q08554 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DSC1Q08554 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DSC1Q08554 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DSC1Q08554 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DSC1Q08554 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
DSC1Q08554 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DSC1Q08554 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
DSC1Q08554 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
DSC1Q08554 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DSC1Q08554 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
DSC1Q08554 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
DSC1Q08554 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DSC1Q08554 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DSC1Q08554 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DSC1Q08554 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DSC1Q08554 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
DSC1Q08554 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DSC1Q08554 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DSC1Q08554 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DSC1Q08554 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DSC1Q08554 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DSC1Q08554 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DSC1Q08554 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DSC1Q08554 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DSC1Q08554 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DSC1Q08554 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DSC1Q08554 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
DSC1Q08554 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DSC1Q08554 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DSC1Q08554 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DSC1Q08554 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DSC1Q08554 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
DSC1Q08554 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
DSC1Q08554 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DSC1Q08554 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DSC1Q08554 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DSC1Q08554 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DSC1Q08554 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DSC1Q08554 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DSC1Q08554 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DSC1Q08554 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DSC1Q08554 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DSC1Q08554 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DSC1Q08554 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DSC1Q08554 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DSC1Q08554 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DSC1Q08554 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DSC1Q08554 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DSC1Q08554 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DSC1Q08554 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DSC1Q08554 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DSC1Q08554 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DSC1Q08554 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
DSC1Q08554 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DSC1Q08554 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DSC1Q08554 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DSC1Q08554 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DSC1Q08554 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DSC1Q08554 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DSC1Q08554 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DSC1Q08554 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DSC1Q08554 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
DSC1Q08554 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
DSC1Q08554 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DSC1Q08554 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DSC1Q08554 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DSC1Q08554 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms