Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC49.93■■■■■ 5.58
TOP2BQ02880 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
TOP2BQ02880 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.89■■■■■ 5.58
TOP2BQ02880 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.85■■■■■ 5.57
TOP2BQ02880 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
TOP2BQ02880 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC49.82■■■■■ 5.57
TOP2BQ02880 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC49.77■■■■■ 5.56
TOP2BQ02880 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC49.71■■■■■ 5.55
TOP2BQ02880 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
TOP2BQ02880 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
TOP2BQ02880 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC49.64■■■■■ 5.54
TOP2BQ02880 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC49.62■■■■■ 5.53
TOP2BQ02880 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
TOP2BQ02880 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
TOP2BQ02880 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
TOP2BQ02880 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
TOP2BQ02880 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
TOP2BQ02880 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.43■■■■■ 5.5
TOP2BQ02880 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC49.41■■■■■ 5.5
TOP2BQ02880 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC49.39■■■■■ 5.5
TOP2BQ02880 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
TOP2BQ02880 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC49.37■■■■■ 5.49
TOP2BQ02880 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC49.27■■■■■ 5.48
TOP2BQ02880 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC49.27■■■■■ 5.48
TOP2BQ02880 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.27■■■■■ 5.48
TOP2BQ02880 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC49.23■■■■■ 5.47
TOP2BQ02880 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.22■■■■■ 5.47
TOP2BQ02880 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.2■■■■■ 5.47
TOP2BQ02880 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC49.2■■■■■ 5.47
TOP2BQ02880 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
TOP2BQ02880 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC49.1■■■■■ 5.45
TOP2BQ02880 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC49.08■■■■■ 5.45
TOP2BQ02880 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
TOP2BQ02880 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
TOP2BQ02880 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC49.05■■■■■ 5.44
TOP2BQ02880 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
TOP2BQ02880 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC49.03■■■■■ 5.44
TOP2BQ02880 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC48.99■■■■■ 5.43
TOP2BQ02880 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC48.99■■■■■ 5.43
TOP2BQ02880 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.41
TOP2BQ02880 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC48.87■■■■■ 5.41
TOP2BQ02880 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC48.86■■■■■ 5.41
TOP2BQ02880 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC48.83■■■■■ 5.41
TOP2BQ02880 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC48.82■■■■■ 5.41
TOP2BQ02880 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
TOP2BQ02880 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC48.8■■■■■ 5.4
TOP2BQ02880 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC48.79■■■■■ 5.4
TOP2BQ02880 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC48.76■■■■■ 5.4
TOP2BQ02880 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
TOP2BQ02880 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC48.75■■■■■ 5.39
TOP2BQ02880 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
TOP2BQ02880 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
TOP2BQ02880 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.39
TOP2BQ02880 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC48.69■■■■■ 5.39
TOP2BQ02880 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
TOP2BQ02880 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
TOP2BQ02880 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC48.68■■■■■ 5.38
TOP2BQ02880 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC48.66■■■■■ 5.38
TOP2BQ02880 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
TOP2BQ02880 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
TOP2BQ02880 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC48.61■■■■■ 5.37
TOP2BQ02880 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
TOP2BQ02880 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC48.53■■■■■ 5.36
TOP2BQ02880 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.51■■■■■ 5.36
TOP2BQ02880 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
TOP2BQ02880 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC48.45■■■■■ 5.35
TOP2BQ02880 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
TOP2BQ02880 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC48.42■■■■■ 5.34
TOP2BQ02880 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC48.37■■■■■ 5.33
TOP2BQ02880 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC48.36■■■■■ 5.33
TOP2BQ02880 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC48.35■■■■■ 5.33
TOP2BQ02880 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
TOP2BQ02880 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
TOP2BQ02880 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
TOP2BQ02880 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
TOP2BQ02880 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC48.15■■■■■ 5.3
TOP2BQ02880 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.15■■■■■ 5.3
TOP2BQ02880 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
TOP2BQ02880 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC48.11■■■■■ 5.29
TOP2BQ02880 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC48.1■■■■■ 5.29
TOP2BQ02880 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
TOP2BQ02880 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.05■■■■■ 5.28
TOP2BQ02880 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
TOP2BQ02880 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC48.01■■■■■ 5.28
TOP2BQ02880 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.01■■■■■ 5.28
TOP2BQ02880 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
TOP2BQ02880 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.99■■■■■ 5.27
TOP2BQ02880 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
TOP2BQ02880 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
TOP2BQ02880 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
TOP2BQ02880 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC47.98■■■■■ 5.27
TOP2BQ02880 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
TOP2BQ02880 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC47.96■■■■■ 5.27
TOP2BQ02880 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
TOP2BQ02880 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC47.91■■■■■ 5.26
TOP2BQ02880 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
TOP2BQ02880 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.25
TOP2BQ02880 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
TOP2BQ02880 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC47.86■■■■■ 5.25
TOP2BQ02880 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms