Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLI1Q01543 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLI1Q01543 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FLI1Q01543 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FLI1Q01543 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FLI1Q01543 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FLI1Q01543 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FLI1Q01543 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FLI1Q01543 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FLI1Q01543 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FLI1Q01543 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLI1Q01543 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FLI1Q01543 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLI1Q01543 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLI1Q01543 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLI1Q01543 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLI1Q01543 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLI1Q01543 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLI1Q01543 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLI1Q01543 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FLI1Q01543 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FLI1Q01543 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FLI1Q01543 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FLI1Q01543 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLI1Q01543 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLI1Q01543 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLI1Q01543 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLI1Q01543 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLI1Q01543 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLI1Q01543 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLI1Q01543 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLI1Q01543 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLI1Q01543 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLI1Q01543 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLI1Q01543 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FLI1Q01543 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLI1Q01543 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FLI1Q01543 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FLI1Q01543 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FLI1Q01543 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FLI1Q01543 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FLI1Q01543 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FLI1Q01543 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FLI1Q01543 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FLI1Q01543 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLI1Q01543 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLI1Q01543 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLI1Q01543 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLI1Q01543 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLI1Q01543 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLI1Q01543 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLI1Q01543 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLI1Q01543 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLI1Q01543 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLI1Q01543 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLI1Q01543 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLI1Q01543 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLI1Q01543 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLI1Q01543 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLI1Q01543 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLI1Q01543 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLI1Q01543 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FLI1Q01543 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLI1Q01543 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLI1Q01543 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLI1Q01543 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLI1Q01543 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLI1Q01543 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLI1Q01543 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLI1Q01543 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLI1Q01543 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLI1Q01543 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FLI1Q01543 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FLI1Q01543 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLI1Q01543 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLI1Q01543 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLI1Q01543 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLI1Q01543 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLI1Q01543 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FLI1Q01543 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLI1Q01543 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FLI1Q01543 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLI1Q01543 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FLI1Q01543 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLI1Q01543 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FLI1Q01543 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLI1Q01543 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLI1Q01543 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLI1Q01543 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FLI1Q01543 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FLI1Q01543 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLI1Q01543 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLI1Q01543 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FLI1Q01543 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLI1Q01543 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FLI1Q01543 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLI1Q01543 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLI1Q01543 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLI1Q01543 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLI1Q01543 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms