Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
PIP4K2BP78356 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
PIP4K2BP78356 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
PIP4K2BP78356 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PIP4K2BP78356 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
PIP4K2BP78356 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
PIP4K2BP78356 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
PIP4K2BP78356 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42■■■■■ 4.31
PIP4K2BP78356 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
PIP4K2BP78356 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
PIP4K2BP78356 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
PIP4K2BP78356 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
PIP4K2BP78356 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41.8■■■■■ 4.28
PIP4K2BP78356 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
PIP4K2BP78356 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
PIP4K2BP78356 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
PIP4K2BP78356 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
PIP4K2BP78356 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
PIP4K2BP78356 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
PIP4K2BP78356 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
PIP4K2BP78356 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
PIP4K2BP78356 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
PIP4K2BP78356 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
PIP4K2BP78356 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
PIP4K2BP78356 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
PIP4K2BP78356 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
PIP4K2BP78356 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
PIP4K2BP78356 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
PIP4K2BP78356 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
PIP4K2BP78356 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
PIP4K2BP78356 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
PIP4K2BP78356 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
PIP4K2BP78356 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
PIP4K2BP78356 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
PIP4K2BP78356 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
PIP4K2BP78356 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
PIP4K2BP78356 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
PIP4K2BP78356 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
PIP4K2BP78356 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
PIP4K2BP78356 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PIP4K2BP78356 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
PIP4K2BP78356 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
PIP4K2BP78356 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
PIP4K2BP78356 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
PIP4K2BP78356 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
PIP4K2BP78356 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
PIP4K2BP78356 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PIP4K2BP78356 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PIP4K2BP78356 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PIP4K2BP78356 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
PIP4K2BP78356 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
PIP4K2BP78356 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
PIP4K2BP78356 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PIP4K2BP78356 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
PIP4K2BP78356 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PIP4K2BP78356 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
PIP4K2BP78356 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
PIP4K2BP78356 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41■■■■■ 4.15
PIP4K2BP78356 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
PIP4K2BP78356 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
PIP4K2BP78356 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
PIP4K2BP78356 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PIP4K2BP78356 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PIP4K2BP78356 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
PIP4K2BP78356 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PIP4K2BP78356 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.86■■■■■ 4.13
PIP4K2BP78356 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PIP4K2BP78356 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PIP4K2BP78356 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
PIP4K2BP78356 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PIP4K2BP78356 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
PIP4K2BP78356 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
PIP4K2BP78356 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PIP4K2BP78356 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PIP4K2BP78356 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PIP4K2BP78356 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PIP4K2BP78356 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PIP4K2BP78356 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PIP4K2BP78356 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
PIP4K2BP78356 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PIP4K2BP78356 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PIP4K2BP78356 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PIP4K2BP78356 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
PIP4K2BP78356 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PIP4K2BP78356 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
PIP4K2BP78356 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PIP4K2BP78356 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PIP4K2BP78356 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
PIP4K2BP78356 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PIP4K2BP78356 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
PIP4K2BP78356 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PIP4K2BP78356 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PIP4K2BP78356 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
PIP4K2BP78356 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
PIP4K2BP78356 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
PIP4K2BP78356 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
PIP4K2BP78356 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PIP4K2BP78356 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
PIP4K2BP78356 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
PIP4K2BP78356 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms