Protein–RNA interactions for Protein: P60412

KRTAP10-11, Keratin-associated protein 10-11, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-11P60412 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP10-11P60412 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP10-11P60412 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRTAP10-11P60412 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRTAP10-11P60412 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP10-11P60412 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP10-11P60412 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP10-11P60412 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP10-11P60412 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRTAP10-11P60412 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP10-11P60412 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP10-11P60412 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP10-11P60412 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP10-11P60412 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP10-11P60412 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP10-11P60412 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP10-11P60412 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP10-11P60412 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP10-11P60412 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP10-11P60412 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP10-11P60412 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP10-11P60412 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP10-11P60412 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP10-11P60412 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP10-11P60412 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP10-11P60412 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRTAP10-11P60412 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRTAP10-11P60412 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRTAP10-11P60412 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP10-11P60412 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KRTAP10-11P60412 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP10-11P60412 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP10-11P60412 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP10-11P60412 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP10-11P60412 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP10-11P60412 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP10-11P60412 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP10-11P60412 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP10-11P60412 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP10-11P60412 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRTAP10-11P60412 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP10-11P60412 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP10-11P60412 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRTAP10-11P60412 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRTAP10-11P60412 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRTAP10-11P60412 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KRTAP10-11P60412 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRTAP10-11P60412 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRTAP10-11P60412 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRTAP10-11P60412 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRTAP10-11P60412 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRTAP10-11P60412 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRTAP10-11P60412 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRTAP10-11P60412 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRTAP10-11P60412 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KRTAP10-11P60412 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRTAP10-11P60412 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRTAP10-11P60412 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRTAP10-11P60412 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP10-11P60412 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRTAP10-11P60412 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRTAP10-11P60412 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRTAP10-11P60412 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP10-11P60412 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP10-11P60412 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP10-11P60412 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRTAP10-11P60412 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRTAP10-11P60412 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP10-11P60412 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRTAP10-11P60412 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP10-11P60412 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP10-11P60412 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP10-11P60412 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRTAP10-11P60412 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-11P60412 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP10-11P60412 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP10-11P60412 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRTAP10-11P60412 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP10-11P60412 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP10-11P60412 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP10-11P60412 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP10-11P60412 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP10-11P60412 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP10-11P60412 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KRTAP10-11P60412 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRTAP10-11P60412 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRTAP10-11P60412 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRTAP10-11P60412 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRTAP10-11P60412 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRTAP10-11P60412 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRTAP10-11P60412 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP10-11P60412 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP10-11P60412 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP10-11P60412 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP10-11P60412 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP10-11P60412 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRTAP10-11P60412 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRTAP10-11P60412 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRTAP10-11P60412 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRTAP10-11P60412 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms