Protein–RNA interactions for Protein: P60411

KRTAP10-9, Keratin-associated protein 10-9, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-9P60411 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRTAP10-9P60411 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRTAP10-9P60411 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRTAP10-9P60411 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRTAP10-9P60411 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRTAP10-9P60411 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRTAP10-9P60411 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRTAP10-9P60411 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRTAP10-9P60411 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRTAP10-9P60411 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRTAP10-9P60411 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRTAP10-9P60411 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRTAP10-9P60411 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRTAP10-9P60411 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRTAP10-9P60411 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRTAP10-9P60411 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRTAP10-9P60411 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRTAP10-9P60411 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRTAP10-9P60411 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KRTAP10-9P60411 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRTAP10-9P60411 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRTAP10-9P60411 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KRTAP10-9P60411 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRTAP10-9P60411 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRTAP10-9P60411 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRTAP10-9P60411 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRTAP10-9P60411 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRTAP10-9P60411 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRTAP10-9P60411 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRTAP10-9P60411 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRTAP10-9P60411 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRTAP10-9P60411 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRTAP10-9P60411 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRTAP10-9P60411 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRTAP10-9P60411 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRTAP10-9P60411 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRTAP10-9P60411 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRTAP10-9P60411 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRTAP10-9P60411 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRTAP10-9P60411 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KRTAP10-9P60411 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRTAP10-9P60411 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRTAP10-9P60411 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRTAP10-9P60411 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRTAP10-9P60411 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRTAP10-9P60411 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRTAP10-9P60411 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRTAP10-9P60411 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRTAP10-9P60411 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRTAP10-9P60411 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRTAP10-9P60411 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRTAP10-9P60411 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRTAP10-9P60411 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRTAP10-9P60411 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRTAP10-9P60411 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRTAP10-9P60411 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRTAP10-9P60411 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRTAP10-9P60411 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRTAP10-9P60411 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRTAP10-9P60411 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRTAP10-9P60411 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRTAP10-9P60411 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRTAP10-9P60411 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRTAP10-9P60411 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KRTAP10-9P60411 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRTAP10-9P60411 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRTAP10-9P60411 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRTAP10-9P60411 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRTAP10-9P60411 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRTAP10-9P60411 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRTAP10-9P60411 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRTAP10-9P60411 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRTAP10-9P60411 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRTAP10-9P60411 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRTAP10-9P60411 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRTAP10-9P60411 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRTAP10-9P60411 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRTAP10-9P60411 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRTAP10-9P60411 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRTAP10-9P60411 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRTAP10-9P60411 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRTAP10-9P60411 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRTAP10-9P60411 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRTAP10-9P60411 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRTAP10-9P60411 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRTAP10-9P60411 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRTAP10-9P60411 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRTAP10-9P60411 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRTAP10-9P60411 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRTAP10-9P60411 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRTAP10-9P60411 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRTAP10-9P60411 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRTAP10-9P60411 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRTAP10-9P60411 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRTAP10-9P60411 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRTAP10-9P60411 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRTAP10-9P60411 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRTAP10-9P60411 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRTAP10-9P60411 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRTAP10-9P60411 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms