Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CTCFP49711 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CTCFP49711 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CTCFP49711 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CTCFP49711 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CTCFP49711 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CTCFP49711 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CTCFP49711 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CTCFP49711 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CTCFP49711 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CTCFP49711 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CTCFP49711 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CTCFP49711 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CTCFP49711 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CTCFP49711 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CTCFP49711 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CTCFP49711 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CTCFP49711 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CTCFP49711 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CTCFP49711 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CTCFP49711 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CTCFP49711 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CTCFP49711 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CTCFP49711 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CTCFP49711 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CTCFP49711 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CTCFP49711 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CTCFP49711 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CTCFP49711 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CTCFP49711 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CTCFP49711 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CTCFP49711 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CTCFP49711 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CTCFP49711 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CTCFP49711 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CTCFP49711 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CTCFP49711 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CTCFP49711 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CTCFP49711 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CTCFP49711 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CTCFP49711 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CTCFP49711 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CTCFP49711 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CTCFP49711 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CTCFP49711 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CTCFP49711 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CTCFP49711 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTCFP49711 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CTCFP49711 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTCFP49711 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTCFP49711 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CTCFP49711 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CTCFP49711 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CTCFP49711 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CTCFP49711 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CTCFP49711 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CTCFP49711 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CTCFP49711 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTCFP49711 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CTCFP49711 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTCFP49711 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CTCFP49711 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CTCFP49711 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CTCFP49711 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CTCFP49711 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CTCFP49711 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CTCFP49711 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CTCFP49711 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CTCFP49711 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CTCFP49711 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CTCFP49711 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CTCFP49711 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CTCFP49711 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CTCFP49711 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CTCFP49711 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CTCFP49711 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CTCFP49711 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CTCFP49711 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CTCFP49711 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CTCFP49711 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CTCFP49711 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CTCFP49711 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CTCFP49711 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CTCFP49711 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CTCFP49711 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CTCFP49711 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CTCFP49711 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CTCFP49711 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CTCFP49711 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CTCFP49711 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CTCFP49711 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CTCFP49711 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CTCFP49711 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CTCFP49711 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CTCFP49711 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CTCFP49711 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CTCFP49711 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CTCFP49711 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CTCFP49711 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CTCFP49711 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms