Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRBP23467 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRBP23467 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRBP23467 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRBP23467 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRBP23467 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRBP23467 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRBP23467 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRBP23467 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRBP23467 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRBP23467 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRBP23467 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRBP23467 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRBP23467 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRBP23467 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRBP23467 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRBP23467 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRBP23467 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRBP23467 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRBP23467 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRBP23467 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRBP23467 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRBP23467 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRBP23467 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRBP23467 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRBP23467 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRBP23467 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRBP23467 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRBP23467 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRBP23467 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRBP23467 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRBP23467 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRBP23467 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRBP23467 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRBP23467 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRBP23467 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRBP23467 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRBP23467 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRBP23467 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRBP23467 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRBP23467 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRBP23467 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRBP23467 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRBP23467 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRBP23467 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRBP23467 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRBP23467 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRBP23467 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRBP23467 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRBP23467 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRBP23467 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRBP23467 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRBP23467 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRBP23467 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRBP23467 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRBP23467 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRBP23467 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRBP23467 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRBP23467 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRBP23467 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRBP23467 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRBP23467 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRBP23467 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRBP23467 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRBP23467 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRBP23467 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRBP23467 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTPRBP23467 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRBP23467 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRBP23467 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRBP23467 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRBP23467 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRBP23467 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRBP23467 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRBP23467 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRBP23467 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRBP23467 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRBP23467 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRBP23467 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRBP23467 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRBP23467 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRBP23467 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRBP23467 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRBP23467 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRBP23467 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRBP23467 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRBP23467 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRBP23467 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRBP23467 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRBP23467 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRBP23467 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRBP23467 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRBP23467 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRBP23467 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRBP23467 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRBP23467 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRBP23467 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRBP23467 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRBP23467 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRBP23467 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
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