Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC52.61■■■■■ 6.01
TOP2AP11388 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC52.53■■■■■ 6
TOP2AP11388 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.51■■■■■ 6
TOP2AP11388 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.45■■■■■ 5.99
TOP2AP11388 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
TOP2AP11388 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC52.4■■■■■ 5.98
TOP2AP11388 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC52.39■■■■■ 5.98
TOP2AP11388 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.38■■■■■ 5.98
TOP2AP11388 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
TOP2AP11388 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC52.33■■■■■ 5.97
TOP2AP11388 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC52.29■■■■■ 5.96
TOP2AP11388 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.18■■■■■ 5.94
TOP2AP11388 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC52.18■■■■■ 5.94
TOP2AP11388 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.11■■■■■ 5.93
TOP2AP11388 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC52.1■■■■■ 5.93
TOP2AP11388 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC52.1■■■■■ 5.93
TOP2AP11388 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC52.09■■■■■ 5.93
TOP2AP11388 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.08■■■■■ 5.93
TOP2AP11388 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.05■■■■■ 5.92
TOP2AP11388 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.97■■■■■ 5.91
TOP2AP11388 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.97■■■■■ 5.91
TOP2AP11388 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC51.95■■■■■ 5.91
TOP2AP11388 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC51.93■■■■■ 5.9
TOP2AP11388 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.91■■■■■ 5.9
TOP2AP11388 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC51.89■■■■■ 5.9
TOP2AP11388 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC51.87■■■■■ 5.89
TOP2AP11388 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC51.84■■■■■ 5.89
TOP2AP11388 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC51.76■■■■■ 5.88
TOP2AP11388 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC51.76■■■■■ 5.88
TOP2AP11388 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC51.73■■■■■ 5.87
TOP2AP11388 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.71■■■■■ 5.87
TOP2AP11388 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
TOP2AP11388 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC51.68■■■■■ 5.86
TOP2AP11388 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC51.59■■■■■ 5.85
TOP2AP11388 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.57■■■■■ 5.85
TOP2AP11388 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC51.56■■■■■ 5.84
TOP2AP11388 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.84
TOP2AP11388 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC51.5■■■■■ 5.84
TOP2AP11388 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC51.48■■■■■ 5.83
TOP2AP11388 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC51.46■■■■■ 5.83
TOP2AP11388 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
TOP2AP11388 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
TOP2AP11388 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC51.4■■■■■ 5.82
TOP2AP11388 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
TOP2AP11388 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
TOP2AP11388 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC51.36■■■■■ 5.81
TOP2AP11388 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC51.35■■■■■ 5.81
TOP2AP11388 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
TOP2AP11388 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.33■■■■■ 5.81
TOP2AP11388 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
TOP2AP11388 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
TOP2AP11388 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC51.28■■■■■ 5.8
TOP2AP11388 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC51.26■■■■■ 5.8
TOP2AP11388 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC51.26■■■■■ 5.8
TOP2AP11388 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC51.24■■■■■ 5.79
TOP2AP11388 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
TOP2AP11388 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
TOP2AP11388 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC51.21■■■■■ 5.79
TOP2AP11388 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC51.2■■■■■ 5.79
TOP2AP11388 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
TOP2AP11388 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.09■■■■■ 5.77
TOP2AP11388 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.05■■■■■ 5.76
TOP2AP11388 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC51.03■■■■■ 5.76
TOP2AP11388 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC51.02■■■■■ 5.76
TOP2AP11388 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
TOP2AP11388 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC50.98■■■■■ 5.75
TOP2AP11388 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
TOP2AP11388 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.96■■■■■ 5.75
TOP2AP11388 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.75
TOP2AP11388 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC50.92■■■■■ 5.74
TOP2AP11388 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC50.85■■■■■ 5.73
TOP2AP11388 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC50.83■■■■■ 5.73
TOP2AP11388 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC50.76■■■■■ 5.72
TOP2AP11388 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
TOP2AP11388 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.69■■■■■ 5.71
TOP2AP11388 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC50.67■■■■■ 5.7
TOP2AP11388 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
TOP2AP11388 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
TOP2AP11388 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.6■■■■■ 5.69
TOP2AP11388 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC50.59■■■■■ 5.69
TOP2AP11388 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
TOP2AP11388 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
TOP2AP11388 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.56■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.56■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC50.52■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC50.51■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC50.51■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.49■■■■■ 5.67
TOP2AP11388 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC50.46■■■■■ 5.67
TOP2AP11388 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
TOP2AP11388 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
TOP2AP11388 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
TOP2AP11388 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
TOP2AP11388 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
TOP2AP11388 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC50.39■■■■■ 5.66
TOP2AP11388 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC50.36■■■■■ 5.65
TOP2AP11388 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC50.36■■■■■ 5.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms