Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
LAMC1P11047 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
LAMC1P11047 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
LAMC1P11047 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
LAMC1P11047 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
LAMC1P11047 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
LAMC1P11047 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
LAMC1P11047 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
LAMC1P11047 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
LAMC1P11047 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
LAMC1P11047 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
LAMC1P11047 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
LAMC1P11047 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
LAMC1P11047 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
LAMC1P11047 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
LAMC1P11047 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
LAMC1P11047 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
LAMC1P11047 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
LAMC1P11047 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
LAMC1P11047 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
LAMC1P11047 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
LAMC1P11047 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
LAMC1P11047 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
LAMC1P11047 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
LAMC1P11047 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
LAMC1P11047 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
LAMC1P11047 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
LAMC1P11047 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
LAMC1P11047 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
LAMC1P11047 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
LAMC1P11047 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
LAMC1P11047 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.19
LAMC1P11047 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
LAMC1P11047 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
LAMC1P11047 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
LAMC1P11047 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
LAMC1P11047 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
LAMC1P11047 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
LAMC1P11047 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
LAMC1P11047 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
LAMC1P11047 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
LAMC1P11047 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
LAMC1P11047 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
LAMC1P11047 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
LAMC1P11047 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
LAMC1P11047 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
LAMC1P11047 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
LAMC1P11047 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
LAMC1P11047 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
LAMC1P11047 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
LAMC1P11047 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
LAMC1P11047 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
LAMC1P11047 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
LAMC1P11047 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
LAMC1P11047 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
LAMC1P11047 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
LAMC1P11047 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC40.81■■■■■ 4.12
LAMC1P11047 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
LAMC1P11047 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
LAMC1P11047 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
LAMC1P11047 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
LAMC1P11047 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
LAMC1P11047 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
LAMC1P11047 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
LAMC1P11047 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
LAMC1P11047 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
LAMC1P11047 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
LAMC1P11047 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
LAMC1P11047 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
LAMC1P11047 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.64■■■■■ 4.1
LAMC1P11047 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
LAMC1P11047 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
LAMC1P11047 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
LAMC1P11047 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
LAMC1P11047 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
LAMC1P11047 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
LAMC1P11047 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
LAMC1P11047 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
LAMC1P11047 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
LAMC1P11047 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
LAMC1P11047 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
LAMC1P11047 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
LAMC1P11047 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
LAMC1P11047 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
LAMC1P11047 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
LAMC1P11047 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
LAMC1P11047 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
LAMC1P11047 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
LAMC1P11047 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
LAMC1P11047 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
LAMC1P11047 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
LAMC1P11047 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
LAMC1P11047 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
LAMC1P11047 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
LAMC1P11047 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
LAMC1P11047 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
LAMC1P11047 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
LAMC1P11047 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
LAMC1P11047 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
LAMC1P11047 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms